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不过就在几天之后，在参政院里就有议员发出了“反对将自然科目引入到科举”的提案，为此也在参政院里展开了激烈的辩论，足足花了一天的时间，这也是参政院实行了会议制度规范之后，对一个提案花费时间最长的一次，当然这也和辩论有多次被打断有关，其中还引发了两次混乱，有五名情绪激动的议员被逐出会场，另外还有大量的议员遭到违规，或警告。
在最后的投票表决中，以一百五十七票赞用，一百五十二票反对，十三票弃权，尽管赞同占了多数，但未能达到投票的半数，因此这一提案并未能通过。
原因就在于，参政院里的议员来自社会各层，真正的传统读书人所占的比例并未超过半数，还有大量的经商者、手工业者、实业者。因此传统观念在这里并不一定有立场。而且大多数人对商毅都十分拥护，诸多因素加在一起，最终出现了这个参政院成立以来，最居有争议的一次投票表决。
不管怎么说，结果己经定了下来。当然商毅也早就做好了被参政院表决通过的准备，就算是被表决通过，商毅也不打算退让，也要强行通过。因为商毅十分清楚，只要自己坚持不动摇，反对的声音就会慢慢自动消失，而学生们也都会去老老实实学习这些自然科目，毕竟十年寒窗苦读，不就是为了金榜提名的那一刻吗？能够真正坚持自己学术原则的人，总是少数，而等考过几次之后，就算再有人反对，也没有用了。
而这时在前次战役中抓到的绍武、永安两个朝廷的皇帝朱聿鐭和朱以海，以及皇室成员，主要大臣一共有一百多号人，也都押送到了南京。
商毅下令，将朱聿鐭和朱以海，以及他们的家人都送到孝陵去给朱元璋守坟，实际就是把他们的活动限制在孝陵的范围之内，等于的变向的监押。并且平时付责一些打扫卫生之类的工作。因为商毅并没有禁止明朝的遗臣去参拜孝陵，但每天只开放一个时辰的时间。因比在这一个时辰内，朱聿鐭、朱以海和他们的家人都将限制行动，不许和外人接触。
在中国历史中，对新兴王朝对前朝皇室的态度如果是大一统王朝，往往比较宽容，一般都会留着养起来，在有些王朝，还比较优待，而如果是分裂时期，则比较严厉，往往会斩尽杀绝。当然元清两朝是例外，因为是异族入侵，由其是清朝，基本将明室的后裔全部都杀光。
商毅并不是一个嗜杀的人，除非是需要立威的时候，一般对俘虏都不会滥杀，顶多就是去做苦工。而且也分别对待，满族、还有日本、朝鲜、荷兰这亗外籍俘虏都是去开矿，或是开山釆石；而汉族俘虏，还比较优待，一般是开垦荒地，或是修路，在干了几年苦工之后，还会释放。
因此商毅也不打算对明朝的后裔下手，而且商毅也并不认为，朱聿鐭和朱以海这些人能够翻得起多大的浪来，毕竟明朝己经是不得人心，注定无法再恢复了。杀了明朝的后裔，只不过是对自己不自信的表现。只不过现在还没有实现全国的统一，才先暂时将他们监禁起来，等商毅统一了全国，统治稳定下来之后，早晚都会将他们释放。而绍武、永安两个朝廷的其他主要大臣，也是一样。当然前提是他们都要老实的接受监禁。
等朱聿鐭、朱以海以及家人安定下来之后，朱媺娖、朱媺婕姐妹也联名送来一些生活用品，向他们表示了慰问，并且也告戒他们，不要再有其他的妄想，老老实实的在孝陵里为太祖皇帝守陵。
其实朱聿鐭、朱以海都不是胸有大志的人，在路上也是提心吊胆，生怕自己到达南京，就会被商毅所杀，但到了南京之后，被安排到孝陵居住，虽然是被监禁，但至少也表示商毅没有杀他们的意思。而且朱媺娖、朱媺婕姐妹也送来物品，更是让他们安下心来。因为朱聿鐭、朱以海都知道，朱媺娖早己经嫁给了商毅，那么这也就代表着商毅的意思。因此也就安心的在孝陵里住下了。
虽然他们的活动被限制在孝陵内，但孝陵的占地面积很大，不在南北京的紫禁城之下，因此并没有拘束的感觉，而且每天的饮食也都供应得比较充足，虽然比不上他们当皇帝的时候，但也不算差，每一餐都有酒有肉，还有时令季节的蔬莱。而每天打扫卫生什么的，也就等于是煅炼身体了，因此两家人在孝陵里住了几天之后，觉得这样的生活也不错，用不着争权夺利，提心吊胆。
而那些一起被送到南京的绍武、永安两个朝廷的其他主要大臣，则都送到南京郊外的一家劳改农场里，和抓到的俘虏们进行劳动改造，其中还一些他们认识的士兵，当每天从事一些简单的农活，但在农场里到是可以自由活动，而且还给他们提供一些书籍和【中华时报】。
这样的处理结果，到这些大臣们有些意外，有不少大臣在来南京之前，是都怀着必死的决心，也有几个人甚致还准备在见到商毅之后，大骂他几句，也有人写好了遗诗，在受刑前作慷慨激昂将的念出来，总之都巳经做好了尽忠取义的准备。
当然也有一部份人心里在盘算，传闻商毅素来礼贤下士，爱材如命，会不会来招揽自己，那么自己也应该注意火候分寸，差不多的时候，就装出被感动的样子来，投到南京政府中去。有些人还在演练自己在被感动的时候，应该是什么样子，说什么话，是作对天长叹状，还是泪流满面，是该说“真圣眀之主也”还是说“非臣不忠，实在是势不可违”。
但谁也没有想到，那知到了南京之后，商毅压根就没理自己，直接仍到农场里进行劳动改造。每个人都在这种不知所措的心态中，开始了自己的新生活。
第169章 局势的变化（一）
其实商毅根本就没有把这些南明旧臣放在心上，还是那句话，关他们只是暂时，等国家稳定下来之后，就把他们都放了，要不然老是关着他们，也没多大意思，还要花钱养着，太不划算了。
这时己经进入了后明六年、清顺治七年（1650年）四冃，在南方战场前线的各部队也都休整得差不多了，统战部也认为，可以进行第二阶段的战斗了。
不过这时战局发生了一些变化，占据云南的大西军余部，接受了永历朝廷的招安，正式加入了永历朝廷，与中华军为敌。
原来张献忠在四川战死之后。大西军在张献忠的妻子陈氏、宰相汪兆龄，和他收养的几个义子孙可望、刘文秀、艾能奇的领导下，收集溃散的大西军余部，重整队伍，率军出川南撤，从川南首先进入了贵州地区，获得了难得的喘息时佪。
而这时大西军的领导层出现了分裂，在贵州的休整期间，孙可望、艾能奇、刘文秀等人也仔细的反思了张献忠的作为，认为大西军以后不能像张献忠那样，胡乱杀人，动辄屠城，还是当以收陇人心为主。而陈氏和汪兆龄则仍然主张滥杀政策。
结果孙可望、艾能奇、刘文秀三人联手杀死了陈氏和汪兆龄，这样就形成了以三人集体领导大西军的体制。而在这三人中，孙可望的年龄最大，而且原来的地位和威信也比另二人高，因此成了三个中间的主要领导人。但重大事情，还是由三人一起商议决定。
而在整肃内部之后，三人也严令各军：自今非接斗，不得杀人。也使大西军出现了气象一新的状况，在贵州省期间，大西军基本能做到秋毫无犯。
不过贵州民贫地瘠，而且又腹背受敌，并不是长驻建基之地，因此三个人也在寻找可以建立基础的地方。而就在这时，明朝的云南石屏土司龙在田邀请大西军进入云南，帮自己平叛。
在崇祯十二年（1639年）的时候，张献忠曾受过明朝的招抚，在湖北谷城驻扎了大半年时间。当时龙在田被明廷调往内地，在湖广、河南平乱，在名议上他是张献忠的上司。而张献忠当时出于策略考虑，曾经拜龙在田为义父，并且从他那里得到了马匹、军械，因此当时张献忠部下的众将，和龙在田的云南军队来往交从比较近密。
后来龙在田己被调回云南，正好这时云南当地的土司沙定州举兵作乱，龙在田不敌沙定州的叛军，跑往大理躲避。听说大西军余部占领了贵州，马上派人携密信通知大西军，请大西军入滇，帮助自已平定叛乱。
结果大西军的战斗力和中华军当然没法比，也不如清军或吴三桂的川军，但比起沙定州的叛军来，还是绰绰有余，入滇之后，很快就击败了沙定州的叛军，占领了昆明，并且与明朝的云南总兵杨畏知、黔国公沐天波达成协议：一，不用大西年号；二，不妄杀人；三，不焚庐舍、淫妇女。双方合力，只用了不到一年的时间，就迅速的占领了云南全境，并擒杀了沙定州。
一统了云南之后，孙可望自称平东王，以刘文秀为抚南王，艾能奇为定北王，封官设职，以杨畏知为华英殿学士兼都察院左都御史，沐天波仍为黔国公，大西军的原将领严似祖为吏部兼礼部尚书，王应龙为工部尚书，丁序焜为户部尚书，任僎为副都御史掌都察院事，马兆羲为学院，张虎为锦衣卫。但并没有建国立号。
然后孙可望等人在云南悉心经营，前后近三年，云南全境大抵平静，既没与清军发生战斗，也没与南明政权有太多接触，基本处于一种相对封闭的境地。由于政策措施正确得当，云南地区的社会安定，生产迅速恢复发展，大西军对云南的统治日益稳定，实力已经大大增强。比张献忠在四川的时候，还要强盛，居说总兵力可以达到三十万。
不过云南毕竟不是世外桃源，孙可望等人也知道，无论是明军还是清军，或者是中华军，一但得势，必然会束进攻云南，在这个乱世的年代，根本就不可能置身事外，早晚都要衼卷进这个时代的风云中去，因此孙可望等人一也在经营云南的同时，一边也没忘了打听外面的情况，寻找主动参�