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对武后的作为李治已经习惯。比如，新立皇后是在宫内，不能在大庭广众中，后宫女人哪怕是皇后也不许与世人见面的。但她非要选择肃义门，性格温柔的李治同意了。不同意怎么行？兴奋无比的新后像个天真的少女，像是磨着她的情人去看庙会。在爆发的万人欢呼的场面，李治还真被感染了，他第一次见到如此热烈的场面。过后，李治仍忐忑不安，这是违反大唐礼制的。然而他的新后却说：“礼制是人创的，我们创造了这个开天辟地的仪式，也要做出先人没有做过的事”想一想，他也心安理得。
李治看着兴致勃勃，脸色红润的武后，心里顿感轻松，前所未有的轻松，好像自己新立的不是皇后，而是皇帝。这是百官的共同想法，更是长孙无忌的想法。李治的轻松，正是因为自认不是长孙无忌的对手，如今既然有人替他上台打擂，才有卸下重担的轻松。何况，替代自己的是妻子。李治，确实儒弱、仁厚。
面对朝局和儒弱的丈夫，武则天感到很沉重。过去自己只想做个梦想的女人，现在她的理想破灭了。她要为丈夫的江山、为自己、为女人去征战，去打倒无比强大的旧势力、旧规矩，她不能错走一步，必须坚定、沉着。她要做男人的事情、要做皇帝的事情了。她虽然仍无做皇帝的妄想，却知道做的是皇帝的事情。不知道成不成，但她要试一试。她很有信心。
为了革敌鼎新，她劝丈夫下诏改元。两个月后，大唐改元显太，以公元656年为显庆元年。随后，她要在显庆元年立自己的儿子为太子。
她已有二子，长子李弘，次子是在即皇后位前生下的，取名李贤，被封潞王。她示意礼部尚书许敬宗上书请另立太子，许敬宗不愧文史显通，他引经据典，以天象为儆，地坤为示，又用通俗形象的枝干、衣裤作比兴，说明必须废去庶出的李忠，而立武后生的嫡子。不然，开象不容、地坤不承、大树倒着栽、衣裤颠倒穿，官民心里不跳实，东宫的原太子心里不安宁。
显庆元年正月，李治下诏立长李弘为太子，于志宁为太子大师，中书令崔敦礼为太子少师，许敬宗、韩瑗、来济为太子宾客，李义府兼太子左庶子。大赦天下。废太子李忠被封梁王，实任梁州刺史。
也正是这个时候祖师清虚驾临告诉武皇后岂有人主帝王命格。
知道自己这位祖师乃是上古人皇神农氏帝师的武皇后对祖师的话根本不会怀疑，而也正是因为这个使得武皇后野心萌生，渐渐的有了掌控天下的心思。
立太子不久，李治又旨尊武士彟为司徒，赐爵周国公，母亲杨氏晋封代国夫人。这年十一月，武后又后一子，取名显，受封周王。为示庆贺，为百官普升勋级。
稳固了自家阵地，武则天开始帮李治整饬朝纲，清理顽旧，向天陇集团扬刀冲锋。
武则天盯住了关陇之首、顽固元戎长孙无忌的一切动作。自武后册立大典甩袖而去后，长孙无忌隐居编撰《武德贞观二朝史》，从编史中更觉武后的可怕，因此一刻也未放心朝局，在幕后策划扼杀武后势力的计划。宰相韩瑗、中书令来济被武后拉入她们的营垒，他知道此二人是两营之关键，他们是关陇干将，不会为武后所用。
于是，长孙氏令韩、来二人首先发难，要求召回褚遂良，并向李治儆示女祸误国的道理，让武则天招架不住。果然韩、来二人仍是关陇干将，他俩咬住李治，反复上奏，并鼓动臣工起哄。韩、来及受鼓动的旧派官员果然掀起一股上书风潮，纷说褚遂良是谋国老臣、社稷干城，“无闻罪状”，为“谗谀相诋”被逐，再不召回，朝臣之心就要乱了。还拿褒姒、妲已这些老掉牙的“赫赫周宗，褒姒灭之”等典，讽谏高这示，冷落武后。
这些招数对武则天来说，已不算招数，她很感到失望。这位曾左右太宗朝纲的权臣、元舅长孙无忌，竟拿不出一式高招对付她。现在是什么时候了，还用红颜误国那个老一套招法，用在李治和她身上，实在不算个招法。就是再让褚遂良回朝又能怎样？人老了，该进坟墓了。她告诉李治，不理他们就完了。果然李治不加理睬，不予允许；韩瑗等人以辞官威胁也不允准。长孙无忌等没办法。
不知是被胜利冲昏头脑，还是本性决定，这时在李义府和皇帝身上出了点纰漏，给敌人抓住把柄，算是后院起了两把火
一个洛州的淳于氏，犯了奸情罪被押在大理寺狱中。李义府听说此女很美，便让大理寺丞毕正义徇情枉法，把她释放，想纳她为妾。大理寺卿段宝玄受朝中旧臣指使，写奏折告发了这件事。李义府害怕败露，便逼迫为他办事的毕正义自杀在狱中。皇帝让给事中刘仁轨主持审理，因毕正义自杀，死无口供，纳妾之事还在准备中。人物两证皆不备，拿李义府无办法。
然而，法律上虽无证据，事实却是不错。关陇集团抓住这可乘之机，想用李义府当突破口，打击武则天他们认为一定是武后在包庇李义府。御史王义方上奏继续审理此案，奏折中直点李义府大名，以为“义府于辇轂（旧指皇帝）之下，擅杀六品寺丞，就云正义自杀，亦由畏义府威，杀身以灭口。如此，则生杀之威不由上出，渐不可长，请更加勘当”这件事在当时闹得很凶，也折冲了几个回合。直弄到李义府在朝廷上与王义方对仗，王大声喝斥义府，李义府受斥而出。武则天见此事内中有两派斗争，就是压着不处理李义府，李治反责王义方“毁辱大臣，言辞不逊，贬葉州司户”。而李义府反升为中书令，掌管军国政令，并兼检校御史大夫。
李治和武则天也知李义府品行不端，在本案中曲在李义府。王义方身为御史，有弹劾大臣之责。其行为也是正当的。但是，此案处在斗争的涡流中，只好这样处理了。这件事让武则天很被动。
由于李治有武则天做依靠，思想放松，加上他生性善良。闲来无事，让侍卫陪着却御花园散布。实际上知道废太后王氏和萧淑妃被囚的地点，平日仍挂念她们。这次散步，本来就想看看她们的情形，心里也没想怎么样。
到花园后逐景生情，想起她们过去陪他在花园的情景，更增添怀旧之情，便顺着幽径走身囚禁之处。
那是一间封闭的石室，门上落锁，唯留一小洞递送食物。时值严冬，石室四壁，满缀冰凌。李治见此，恻然酸鼻。不禁喊道：“皇后、淑妃，你们在里面吗？”石室内慢慢传出哭泣之声。废后王氏哭着回答：“妾等罪人，做了囚犯，哪还有这等尊称啊”又说：“皇上如念昔日情分，使妾等重见日月，请皇上为此院取名回心院吧。”李治安慰说：“朕想泫处置，你们不必过于悲伤了。”
武则天得知此事，甚为生气。她深知李治心软重情，怕与她们旧情未断，节外生枝，此时万不能出错。于是，决定除去二人，免生祸端。
她派人把二人拖出，各打一百伏，还砍掉手足，再杀死。临刑前，二人骂不绝口。武则天还下令改王氏为蟒氏、萧氐为枭氏。
至此，朝内关陇官僚集团土崩瓦解了。与贬逐褚遂良等人的同时，礼部尚书许敬宗被提升为侍中，兼任度支尚书（即户部尚书），以度支尚书杜正伦兼中书令。而李义府终是个品质不端的小人，一朝得志贪得无厌，他全家母子、妻儿全部贪赃枉法，卖官鬻爵，收受贿赂。因他与杜正伦不合，两人都到朝适互相指控。李治被气得没法，把他们二人也同时赶走，杜正伦贬为横州剌使，贬李义府为普州刺史。
现在，关陇集团只剩下一个光杆司令长孙无忌了。武则天知道，不除去关陇之首，早晚仍有祸害发生。但要除掉他，最大的阻力却正是自己的丈夫唐李治。
那是四年四月，洛阳人李奉节控告太子洗马韦季方、监察御吏李巢结党营私的事。李治令许敬宗和辛茂将审理此案，是不是许敬宗讯供太急，韦季方竟自杀而未死。因韦季方是长孙无忌的门生，许敬宗就按韦季方与长孙无忌一起陷害老臣，使权归无忌，伺机谋反，如今事情暴露，故自杀的案情，上奏李治。李治自不相信，说：“岂有引理这是有人故意陷害我的舅父，舅父绝不会谋反的”许敬宗强调：“经臣反复推究，长孙氏的反状已很清楚，如果陛下还犹豫怀疑，恐怕对社稷很不利啊”
李治是个胆小无主见，又不能深思熟虑的人。听许敬宗一吓唬，心路更乱。长孙无忌一直在反对立武氏为皇后，自从立武氏以来就不到朝廷上来了，舅父一点也不给他和武后退路。前些日子，众官员纷纷上书，把武后当祸水辱骂，就是把他当成夏桀、商纣、周幽这些昏君来比喻，这也都是舅父在指挥着做的。难道说，舅父真在背后策动谋反吗？
想到这里他流着泪说：“我家太不幸了，亲戚之间屡有异心，往年高阳公主与房遗爱谋反，今天老舅也谋反，我还有什么脸面见天下之人啊如果舅父谋反之事是真的，让我怎么办啊”
许敬宗见李治思想动摇了，马上顺着他的思路上