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以备政权更替可能发生的不测之事，武皇太后派左威将军王果、左监门将军令孤智通、右金吾将军杨玄俭、右千牛将军郭齐宗分往并州、益州、荆州、扬州四大都督府，与府司相知镇守。
武皇后的出手果然不凡，经她果决处置，很快就稳定了李治去世后的内外政局，并加强了中央和地方的统治力量。使朝野为敬服。
一切都很好，也很对。但是，却在皇帝身上出了问题。
公元684年旧历大年初一，因为新皇帝登极，乃改元嗣圣元年，大赦天下。第二天立太子妃韦氏为皇后，又把她做普通参军的父亲韦玄贞提升为豫州刺史，豫州是中原要冲，管辖东都洛阳周围的州县。然而，中宗李显还嫌提拔的官位不高，第二天又要提为侍中，侍中是当朝宰相，为朝中首辅之一。而且，连中宗的奶**儿子都要授为五品官。
皇帝的这个决定也太荒唐、太离谱了。作为辅政大臣、中书令的裴炎苦苦地劝谏，坚决不同意皇帝的决定。韦玄贞没给国家立一寸功劳，仅是一个小州的帮闲小吏，两天之内就要提拔到宰相的高位上，其德其才其功业都太不可思议，这哪是一个皇帝可以做的决定呢，所以才“固争”。
韦后是个貌美而极有心计的女人，其实中宗的决定都是韦后出的主意。中宗惧内而对下属却非常傲慢，他见裴炎不同意他的决定，便大声喝斥裴炎，并说：“我就是把天下送给韦玄贞又有什么有可以的，何况一个宰相呢”裴炎听了很害怕，就把这事告诉了武皇太后。
武皇后听了非常生气。这个李显竟然如此荒唐没出息，比自己估计的坏上百倍，没做几天皇帝就为老婆做出这等事来，将来让他掌握了朝中实权，天下不知道会乱成什么样子所以，不能再让他当皇帝。但是，以前为了李弘和李贤已经让朝野误解太大，如今李治已逝、了显做皇帝又没有几天，朝野正在盯着她，而好不容易让局势稳定，如果不废新君，李氏宗族、文武百官、朝廷内外，不知道怎么闹腾，甚至会借此发动兵变，其不堪设想啊但是，既然李显糊涂透顶、不堪为君，她宁可担着自己再被误解、再被指骂，也决不能犹豫不决。她想，为了李家天下（当时她仍这么想），为了天下苍生，为了对得起天地良心，李治在九泉之下也会同意和原谅自己，而如果是太宗，就更会毫不犹预地这么做。于是她当机立断，与裴炎一起商量君主废立之事，在商量定具体措施安排之后，她亲自草拟了废黜皇帝的命令。
嗣圣元年二月戊午日，武皇后在东都洛阳的乾元殿召集百官大会。先令羽林将军程务挺、张虔勗率领羽林军入宫警戒，选拔高级卫士到乾元殿上戒备，由裴炎和中书侍郎刘祎之总负责。
大唐宫室笼罩在一片紧张的气氛之中，坐在乾元殿里的百官个个惊恐、面面相觑，不知道发生了什么大事。宰相裴炎出班，当众宣布皇太后的命令：“中宗昏庸无德，不堪为一国之君，立即废为庐陵王”命令宣罢，立命卫士扶中宗下殿。中宗抗声大叫：“我有什么罪？”武皇后大声斥责：“你想把江山给韦玄贞，还说无罪”于是，把中宗软禁在别殿里，恢复了李哲的名字。中宗的长子、皇太孙李重照也被废为庶人。韦玄贞被流放到钦州（今广西钦州）。
第二天，改立武皇后的第四子预王李轮为皇帝，赐名旦，他就是睿宗皇帝，这年他22岁。他的王妃刘氏是刘审礼的孙女，刘审礼曾在对土蕃的征战中受伤，被俘死在土蕃。如今刘妃被立为皇后。李旦长子李成器被立为皇太子。改年号文明元年。
即位月余的中宗被废，朝野又起议论之风。李氏宗室、百官人等，皆攻击她图谋取而代之。
为防万一，武皇后任命刘仁轨为西京留守，命左金吾将军丘神绩去巴州，检查防守被废太子贤的住处，以防李贤被人利用。任命太常卿、检校豫王府长史王德真为侍中。任命她一手提拔的中书侍郎、检校豫王府司马刘伟之为同中书门下省三品。又徒封杞王李上金为毕王、鄱阳王李素节为葛王，李治驾崩，他们同赴父亲的丧事，丧事完毕，武皇后让他们出任外州刺史，以示对李治亲子的优容。
议论归议论，却无人敢于当面指斥或犯颜直谏。唯有刚被任命为西京长安留守、已八十三岁高龄的老臣刘仁轨上表直谏。武皇后委任他时曾给他写信说：“昔汉以关中事委萧何，今托公亦犹是矣。”表示对他的信任和重托。但刘仁轨是上疏辞任，要求告老致仕。再进一步劝谏说：汉朝的吕太后临朝任用外戚，事情弄坏了留在祸害，又被后人笑话。表中有言曰：“吕后见嗤于后代，禄、产贻祸于汉朝”。说的汉初发生的重大宫廷变故，武皇后心里很清楚的。那是刘邦死后，懦弱的汉惠帝刘盈即位，大权落在母后吕雉的手中。吕后控制朝政十五年，封侄子吕产、吕绿为王，形成诸吕一派，排挤功臣、迫害刘氏宗亲，搞得乌烟瘴气。待吕后一死，高祖的亲信大臣周勃、陈平等人把诸吕一网打尽，朝野无不称快。吕氏弄得汉初政潮翻滚，人心不宁；而吕后成了外戚专权的反面教材，为后人嗤笑。
武皇后看了刘仁轨的奏表，便委派秘书监、侄儿武承嗣带去一封信安慰他，希望他不要辞职，并回答了关于汉初吕后专权的认识。那封信写的恳切感人。信中说：
今以皇帝谅闇不言，眇身切代表政。远劳劝诚，复辞衷疾。又云“吕氏见嗤于后代，禄、产贻祸于汉朝”，引喻良深，愧慰交集。公忠贞之操，终始不渝，劲直知风，古今罕比。初闻此语，能不罔然；静而思之，是为黾镜。况公先朝旧德，遐迩具瞻，愿以匡救为怀，无以暮年致请。
此信足以显示武皇后政治家的气度和胸襟，她认为刘仁轨用吕后的事来劝告她，表示了刘仁轨的品质忠贞、耿正、高风亮节，能敢于直谏，是“劲直知风，古今罕比”。她真诚地表示，“初闻此语，能不罔然”，但静下来思考，真是一面明镜啊所以，表示感动、惭愧和快慰。因此，诚望您作为先朝的老臣，能以匡救天下为怀，不要丢下我们不管，不要因年老而告退。正因为武皇后披沥胆表明心迹，才让刘仁轨不再要注告退，以后一如既往，忠心耿耿地为太后做事。
刘仁轨代表了老一代大臣，自己尖刻地拿吕后比武皇后，竟受到了尊重。这不仅是武皇后的政治风度，也表现了她的坦荡胸怀。所以，他的德高望重的声誉，继续受重用，继续为武皇后努力工作，就以一种无声的力量，堵住了许多官员之口。
当然，政治斗争毕竟是残酷的，有时会流血、会死人。
对那些直接影响统治地位的人，武皇后则直接或间接地消灭。一天，十几个参加废黜中宗的骑兵在酒坊里饮酒，议论着废黜中宗的事。其中有的说：“早知道没有勋赏，还不如拥立庐陵王当皇帝”其中一个人听后，悄悄出来，跪到玄武门告密。结果，饮酒的人没离座，就全被逮捕，关进了羽林军的狱中。第二天，在酒桌上非议的那个人被斩首。其他人知而不报被处以绞刑，好个告密的得到了五品官职。
再说那个被废的太子李贤，在这政治动荡的非常关口，武皇太后派左金吾将军丘神绩去巴州他的住宅检查，开监视他和周围人的行动。丘神绩到了巴州，把李贤软禁起来，逼令他自杀＇《西京杂记》，卷第9页。＇。当丘神绩回到洛阳后，武皇后宣布是他擅自杀死了故太子，把他贬为叠州刺史。又在显福门为李贤举哀，并追封他为雍王。很快又快复了丘神绩的原官。
这一过程，同样表明武皇后为巩固政权，对可能发生变故的重要人物，采取了坚决态度。李贤曾经密谋造她的反，对她早无母子之情，而李贤也认定她不是生身之母，对她极为仇恨。因此，在这非常时期，她认为李贤是个危险人物，可能被人利用来对付自己，所以只有牺牲他，以绝祸患，才密令丘神绩去逼其自杀的。不然，丘神绩是不敢擅杀李贤的，他虽然是被废太子，毕竟是李治之子，那要遭到杀身灭族的。不会只被贬放，而且很快又官复原职的。所以，丘神绩的举行，是受武皇后指使的。
与此同时，武后又把庐陵王李哲迁往湖北的房州（今湖北房县），几天后又迁到均州。如此迁来迁去，武皇后也在为政权的威胁和安全考虑。
睿宗李旦生于龙朔二年（第八子、武皇后的第四子，是李治武皇后的子女中最小的一个，被立为皇帝时也二十二岁了。刚出生就被封为殷王、领冀州大都督单于大都护、右金吾卫大将军。但是，他自幼年就养成爱读书、爱书法、爱文学的习惯，从来就没有王位、将军官衔放在心上，更不去想自己是一个王子，将来有可能做皇帝的事。正史为他论定为“谦恭孝友，好学，工草隶，尤爱文字训诂之书”。真是为他想得周到啊果然此计好用。这不，杀人狂武皇后就是被他的小儿子懵住了。守株待兔，最后皇位被他等个正着。
哎其实李旦并不怎么感谢通晓孙子兵法的先生们，也根本不懂你们为他出的那些鬼�