当然，威尔逊不用秘密外交，他明确表示1917年协定不牵涉美国。他也被迫对日本采取强硬态度。美国公众反日情绪强烈，一方面由于常年不断的日本移民，一方面由于对德和约进程。墨西哥是另外一个问题；美国人认为日本给墨西哥内战中错误的一方出售武器。1917年，为了使日本加入同盟国，德国总理在一封臭名昭著的齐默曼电报中让墨西哥邀请日本加入反对美国的联盟。不公的是，这使日本人再次留下不好的印象。战争末期，日本以反对布尔什维克为幌子扩张至西伯利亚时，威尔逊也和公众一样厌恶阴险的日本。他现在担心的是，如果日本控制北太平洋诸岛，它就有了一系列跳板可以使它跨过太平洋直奔夏威夷。他的军事顾问警告这些可能成为日本未来的基地和飞机场。
1919年1月27日，牧野向最高委员会宣读一项声明，提醒诸位日本从德国手中夺回的岛屿保证了战争中运送航线的安全。他带着殖民主义者的口吻说，当地人非常落后，日本的保护和仁慈只会使他们受益。威尔逊温和地强调说他主张委任统治，不赞成直接占领。他不准备在这些岛屿问题上与日本对抗，因为他对日本的其他要求如德国在山东的特权也有异议。他克制地说：“美国不同意日本委任托管雅浦岛，这里地处加罗林群岛西端，是国际电缆的重要枢纽。”美国人反复提议在今后几年内采取国际管控，但没有成功。1919年，日本得到所有想要的岛屿的委任统治权。
两次大战之间，美国海军的担忧都成了事实。虽然委任统治严禁建立军事基地和防御工事，但事实证明这根本无法贯彻实行。外国人参观这些岛屿越来越难，而日本又向岛内移民并驻军。在那里，日本人修建了大港口；位于加罗林群岛中部的特鲁克群岛成为日本在南太平洋的主要海军基地。战争中，原本微不足道的小岛——天宁岛，###及特鲁克群岛——都变成重要战场。
国联盟约中的“种族平等条款”引出的麻烦更多。它对日本人有重大的象征意义。日本是个世界强国，其国民应该受到尊重。不幸的是，在美国和白人世界，人们想像东方移民浪潮淹没了白人文明。战前几年，日本商人抱怨他们经常在国外受辱。在加利福尼亚，日本人丧失了买地的权利，然后是租地权，最后连妻子都不能来美国一起生活。1906年，旧金山学校董事会将中国和日本孩子（总共不到100人）隔离到单独班级以免他们超过白人儿童。日本人（还有中国人和印度人）发现去加拿大和美国越来越难，去澳大利亚根本不可能。甚至在战争期间，虽然日本是大英帝国同盟，其国民还是被拒之门外。
日本政府一直试图调和，提出限制移民数量，但同时要承受来自公众的压力。如1913年，当一位演讲者在一次会上说日本应该宣战，拒绝接受有关土地所有权的加利福尼亚法律时，20，000名日本人欢呼不已。1916年，日本政府生硬地对英国说：“很遗憾英国殖民地的反日情绪依然强烈。”当日本决定参加和会时，日本报纸一片劝诫，一篇社论说：“现在是为反对国际种族歧视而战的时候了。”
资深政治家告诫政府，日本应该慎重对待国联。如果它只是维持现状，把日本定位于二流国家怎么办？甚至连威尔逊做出的新外交许诺也值得怀疑。一位年轻的爱国者在一篇反响强烈的文章中写道，民主和人道主义固然很好，但他们只是英美企图维护其对世界财富霸权的幌子。近卫王子写道，日本要生存，就得更加进取。日本政府指示其代表团拖延国联，可能的话，要确保国联盟约中包含禁止种族歧视的条款。近卫作为西园寺的助理一起前往巴黎。多年之后，日本与美国交战时，他担任首相。1945年，在审判战争罪之前，他服毒自杀。
当然，威尔逊坚持把国联作为和会的首要议题，因此日本人在幕后悄悄地准备种族平等条款。2月初，牧野和真达拜访一向热心友好的豪斯。他说他一直憎恨种族歧视并将竭尽全力帮助他们。几天后，和鲍尔弗讨论时，他就没有这么乐观了。他尝试了几种方案，但困难在于日本人不想要纯属安慰性的措辞，而对其他人来说——如澳大利亚人——任何有关种族平等的条款都难以接受。鲍尔弗和往常一样冷静客观：人人生来平等的观念很有趣，但他不相信，你不能说中非人和欧洲人平等。他还警告豪斯，英美人民都把它看作解除日本移民限制的第一步。豪斯回答说他意识到这一点了，但日本的确存在人口过多问题。他满怀希望地说，也许，他们可以去西伯利亚或巴西。
日本和种族平等（5）
在国联事务委员会，牧野和真达小心翼翼地让别人知道他们正在准备一项将在合适时机提出的条款。2月13日，当国联盟约第一草案准备就绪时，牧野宣读了一篇冗长的声明，希望在有关宗教信仰自由的条款中增加一些内容：国联所有成员同意平等对待各国公民。他发现种族偏见很深，但重要的是达成一致原则，然后让各国自定政策。他接着说，国联将是个大家庭，各国互相关心，因此没有道理让一国人民为歧视他们的他国人民做出牺牲，甚至献出生命。大战中，不同种族并肩作战，“我们被前所未有的同情和感激之情紧紧地联系在一起”。
声明虽然感人，却毫无作用。塞西尔代表英国说，这是个颇具争议的问题，已经在大英帝国代表团内部引出了麻烦，他认为最好以后再解决这个问题，大家普遍赞同。希腊首相维尼泽洛斯提议，也许，他们应该取消整个有关宗教自由的条款，因为它本身也是个棘手的问题。对此，葡萄牙代表团坚决反对，声称他们从未签订过不提及上帝的条约。塞西尔幽默地回答说，这次他们都可以尝试一下。最后，将交付和会全体会议讨论的草案中没有涉及种族或宗教平等。日本人明确表示他们会再次提出该问题。第二天，2月14日，威尔逊回国，国联被搁置一旁。
然而，种族平等条款却开始引起公众关注。日本人公开###要求取消“耻辱徽章”。美国西海岸的政治领导警告白人，如果该条款通过，后果将非常严重。劳合·乔治重述了另一个普遍存在的误解：这个条款也针对生活在诸如澳大利亚和美国等地的日本人遭受的歧视。
在巴黎的调停人中，日本人最多只能得到冷淡的支持。同样遭受歧视的中国人觉得他们也许应该赞成，但正如一位中国代表对一位美国人所说，他们还有更重要的问题要解决——特别是日本在中国的要求。威尔逊必须考虑国内的民意而且他越来越怀疑日本人。他对一位专家说：“我曾经信任过他们，但他们违反了有关西伯利亚的协定。”此外，在种族问题上，威尔逊的观点不太自由。毕竟，他是个南方人，虽然第一次总统竞选时，他提倡黑人享有选举权，但就职后，他几乎没有为黑人做过什么。
反对种族平等的最大呼声来自大英帝国代表团——尤其是澳大利亚的休斯。和多数同胞一样，休斯坚信该条约是保护澳大利亚的堤防的第一道裂口。他的一个下属写道：“如果它损害白人主导的澳大利亚，没有哪个政府能多存活一天。我们的立场是——日本的提议要么有所图要么毫无意义：如果是前者，就放弃，如果是后者，为什么还要提出？”休斯拒绝豪斯提出的任何让步，他说：“也可以，不过一同意，我就将踏入塞纳河，或浮黎·贝尔杰剧院——不穿衣服。”新西兰的马赛表示赞同。这使英国陷入尴尬境地，他们很想保持与日本的联盟，但又必须重视其领地。
2月中旬到3月中旬，趁威尔逊在国内，英国竭尽全力解决这个问题。利益不受威胁的法国在一旁乐不可支地观望。博登和斯马兹在休斯和日本代表团之间来回穿梭。他们安排牧野和真达拜访休斯，日本人认为休斯是个“农民”；而休斯抱怨他们“屈膝跪拜、谄媚奉承”。澳大利亚人允许他接受该条款，但要包含一项不改变移民政策的限制性条款，但这次日本人拒绝了。牧野和真达反复向豪斯求助。但他们错了，豪斯并不准备做不受美国人欢迎的事。私下，他很高兴英国人不得不反对种族平等条款，“把如此负担从我们肩上推给英国人需要手腕和技巧，值得高兴的是，我们做到了。”
背负国内压力的日本代表团决定坚持该条款。真达对豪斯说，失败了至少能证明我们尽力了。4月10日，在国联事务委员会的一次会议上，日本人宣布他们第二天将介绍他们提出的修正案。豪斯的女婿戈登·奥金克洛斯说，他们多次延期，使它成为了一个玩笑。4月11日，委员会直到深夜才开会，试图提出一个允许美国维持门罗主义并加入国联的方案。当日本人提议在盟约导言中涉及种族平等时，所有人都已经疲惫不堪了。牧野和真达说起话来都温和镇定，给人们留下了好印象。委员会其他代表——维尼泽洛斯，奥兰多，中国的顾维钧，法国代表布尔茹瓦和拉诺德以及捷克总理——挨个表示赞同。塞西尔看起来非常不适，他只说他不能支持，然后垂下眼睛，阴郁地坐着。
其他人谈话时，豪斯递给主持会议的威尔逊一张便条：“麻烦在于，如果委员会通过了，全世界都会引发种族问题。”威尔逊清楚，只要提到种族平等就会疏远西岸的重要政治家，而他需要他们的支持以使国会通过国联。他督促日本人撤回他们的要求，说不该对种族偏见大惊小怪，那终将会损害国联；而在座的人都知道国联建立在国家平等的基础上。没有必要多说，他已经在用尽可能友好的口吻和日本人讲话了。他知道他们的动机是好的，但他觉得他应该提醒他们走错了。日本人坚持要求投票表决。当大多数代表赞成修正案时，威尔逊却以大学教授擅长的手腕宣布：由于�