他说，韩日之间不幸的历史问题尚未得到解决，这对于韩日两国乃至东北亚的和平与繁荣都是不幸的。
潘基文强调说，日本应立即放弃使其在历史问题上的道歉变成空谈的言行。韩国政府敦促日本方面停止在独岛主权问题上的挑衅，并且希望日方认识到，只有向年轻人传授正确的历史，在坦诚直面历史的基础上，韩日才能发展面向未来的关系。
在维护韩国利益上，潘基文这个“丝绒手套包着的铁拳”没有手软。对于日本，潘基文大声地说出了“不”，这让人们见识了这位外交官柔中带刚的一面。法新社评论说，潘基文在处理韩日紧张关系时的巧妙外交同样受到广泛称赞。
朝核问题的斡旋者（1）
美国 《 时代 》 周刊曾将朝核问题评价为“我们这个时代最精彩的一幕地缘政治好戏”。
潘基文在出任外长前后的十几年中，他的主要工作之一，就是在这幕重头戏中担任调停和斡旋。
在这里，简要回顾一下朝核问题的由来。
在朝鲜战争期间，麦克阿瑟就屡次威胁要对朝鲜使用核打击。停战后，美军驻留韩国，并于1958年1月开始在韩国部署多种核武器，到1967年达到最大规模时大约有8类950个核弹头。
朝鲜战争以及战后美国核打击的现实威胁，促使朝鲜金日成主席启动了核计划。20世纪50年代末，朝鲜就已开始了核技术的研究工作。60年代初，朝鲜建立了“宁边原子能研究所”，由前苏联培训了部分核技术人才，并引进了第一座800千瓦的核反应炉，至此，朝鲜的核技术研究初具规模。1979年，朝鲜用自己的技术开始动工建设实验用核反应堆；1986年，朝鲜在宁边附近新建的一个20兆瓦热反应堆开始运行——这是朝鲜核计划的里程碑。
1985年12月，朝鲜加入《 不扩散核武器条约 》，以便在和平使用核能方面获得技术援助。但朝鲜一直拒绝履行接受国际原子能机构对其核设施进行检查的义务。90年代初，美国以其卫星照片为据，怀疑朝鲜正在研制核武器，开始强烈要求进行核查，朝鲜核危机初步呈现。
1991年12月31日，朝鲜同韩国在板门店草签了 《 关于朝鲜半岛无核化共同宣言 》，紧张气氛才有所缓和。
1992年1月30日，朝鲜在维也纳同国际原子能机构签订了全面保障监督协定。2月19日，朝韩两国总理在朝鲜北南第六次会谈中，分别宣读了由金日成主席和卢泰愚总统批准的 《 北南和解、互不侵犯与合作交流协议书 》及《 关于朝鲜半岛无核化共同宣言 》。4 月9日，朝鲜最高人民会议九届三次会议批准了朝鲜同国际原子能机构签订的全面保障监督协定。5月25日，一个由7名成员组成的国际原子能机构调查团抵达平壤，开始对朝鲜进行为期两周的核调查。
1993年3月12日，因美国和韩国继续进行“协作精神”联合演习，同时国际原子能机构要求检查朝鲜军事设施，朝鲜宣布3个月后退出它于1985年底加入的 《 不扩散核武器条约 》。6月2~11日，朝美第一次正式会谈在纽约举行。双方在4轮会谈后发表的联合声明中保证不使用包括核武器在内的武力和以武力相威胁，保证朝鲜半岛的无核化、和平与安全，互相尊重主权，互不干涉内政，支持朝鲜半岛和平统一。朝鲜宣布暂不退出 《 不扩散核武器条约 》。
1994年10月21日，朝鲜谈判代表团团长姜锡柱和美国首席谈判代表加卢奇在经过3个多星期的紧张谈判后，在日内瓦签署了 《 朝美核框架协议 》。根据协议，朝鲜同意冻结现有的核计划。此外，朝鲜还同意将来接受对其所有核设施的检查。按协议规定，美国将负责在2003年底前，为朝鲜建造一座2000兆瓦或两座1000兆瓦的轻水反应堆。反应堆建成前，美国将同其他国家一道向朝鲜提供重油，作为能源补偿。
但到2002年10月，也就是金日成之子金正日被推举为朝鲜劳动党总书记5周年的时候，朝美矛盾急转直下。平壤指责美国援建的两座轻水反应堆基本工程仅完成了24％左右，而且自国务卿奥尔布赖特2000年10月访朝之后，华盛顿的对朝政策再无积极的表示，布什总统还曾在2002年初国情咨文中把朝鲜和伊朗、伊拉克一并列入“邪恶轴心”。2002年10月3~5日，美国负责东亚太事务的助理国务卿凯利访问朝鲜。回国之后，他向政府汇报说，朝鲜向他承认了没有停止发展核计划。不过关于凯利的说法双方一直各执一词。11月14日，美国正式宣布，由于朝鲜没有履行1994年朝美核框架协议，决定从12月份开始中止对朝供应重油，并希望朝鲜半岛能源开发组织的成员国也停止向朝鲜供应重油。
在美国停止向朝鲜提供重油后，朝鲜于2002年12月22日宣布解除核冻结，拆除国际原子能机构在其核设施安装的监控设备，重新启动用于电力生产的核设施，并于2003年1月10日发表声明宣布退出《 不扩散核武器条约 》，但同时表示朝鲜无意开发核武器。朝鲜核问题由此再次凸显。
朝核问题的斡旋者（2）
朝鲜半岛自50多年前的朝鲜战争以来一直存在着军事对峙，朝核问题实际上是冷战对抗的延续。朝鲜指控美国对其国家安全构成最大威胁。朝鲜认为，朝鲜核问题是由美国敌视朝鲜政策造成的，要解决核问题首先需美国转变对朝政策。朝鲜重申，只要美国不放弃敌视朝鲜政策，朝鲜也就不能放弃核遏制力。
为解决问题，朝鲜一直要求与美国进行直接对话，并多次提议与美国签订互不侵犯条约，但美国则要求朝鲜先行放弃核计划，并坚持认为处理朝核问题的恰当方式是通过多边对话。
2003年4月23~25日，中朝美三方在北京举行了三方会谈。中国外长李肇星说，这是一个好的开端。
7月12日，在朝韩第十一次部长级会谈中，韩方提出了举行“扩大多边会谈”的建议。
8月1日，朝鲜外务省发言人说，朝鲜已向美国提出就解决核问题直接举行由中、朝、美、韩、日、俄
参加的六方会谈，并在此框架内举行朝美双边会谈的方案。同日，布什在白宫对记者说，朝鲜同意举行有关朝鲜核问题的六方会谈是“一个积极的事态发展”。联合国秘书长安南当天也对六方会谈表示欢迎。
同年8月27~29日，由中国、朝鲜、美国、韩国、俄罗斯和日本参加的关于朝核问题的六方会谈在北京举行。这以后，又陆续进行了四次六方会谈。
早在90年代，潘基文就积极参与了和平解决朝核问题的工作。1991年韩国和朝鲜签订朝鲜半岛无核化共同宣言，当时他的父亲去世，但他还是坚持谈判。后来据媒体报道说，他的这个做法打动了朝鲜的代表，而且确实在无核化的谈判中起了很大的作用。潘基文作为驻美公使期间，美朝因为第一次核危机闹得差点打起来，据报道，潘基文在说服美国同意达成核框架协议方面作了许多幕后工作。
在担任卢武铉的外交顾问和担任外交通商部长官后，潘基文更是积极推进六方会谈。他穿梭于中国、美国等国家之间，通过多种渠道与朝鲜接触，促使朝鲜坐到谈判桌前。
潘基文多次表示，为了实现朝鲜半岛无核化的目标，韩国在和朝鲜谈判时将保持坚定和耐心。韩国将在六方会谈中采取更灵活的态度，并将向朝鲜提供安全保证，换取朝鲜放弃核项目。
六方会谈的进展并不顺利，在第三次会谈后，谈判一度陷入僵局，原定于2004年9月举行的第四次会谈搁浅。为了重启六方会谈，潘基文积极施展他的智慧和外交能力。
潘基文指出，美国与朝鲜之间的互不信任正损害各方为重启朝核六方会谈所做出的努力。潘基文还指出，没有必要过分关注美朝双方日益激化的“口水仗”，“ 重要的是关注六方会谈中各国的立场，而不是对这些措辞本身过分紧张”。
潘基文一方面告诫朝鲜，“核武器最终无法保障朝鲜安全，只会造成并加深朝鲜在政治和经济上的孤立。朝鲜应该认识到，拥有核武器并与国际社会保持着正常关系是不可能的”。另一方面，他也敦促美国避免挑衅朝鲜。他说，美国高官将朝鲜称为“暴政前哨”，这不利于当前的朝韩和解气氛，并对此表示遗憾。他强调，希望相关国家认真配合，不要做出可能会刺激朝鲜的言行。他说：“我公开提出，朝鲜不应当受到挑衅。积极气氛正在发展之际，这么做不必要。我向赖斯国务卿解释说，美国和其他对话伙伴行为需慎重。她表示理解。”同时，潘基文也敦促朝鲜回到谈判桌前来。“关于朝鲜要求美国政府就赖斯‘暴政前哨’的指责进行道歉问题，赖斯已经作出了很多关于朝鲜主权、美朝在会谈框架内进行双边对话等具有外交意义的讲话。现在，朝鲜应该正确理解这些发言的涵义，回到谈判桌前。”
为了将朝鲜拉回六方会谈中，2005年7月，韩国提出了一个被称作“新马歇尔计划”的“重大提案”——直供电方案。
朝核问题因电力而起，朝鲜生存确实亟需电力供应。新华社首尔分社首席记者张锦芳说：“韩国此次拟向朝鲜提供的电力，正好是现已停工的援朝轻水反应堆的装机容量。韩国愿向朝鲜提供电力，可被视作停建轻水反应堆的补偿，将为推动解决朝核问题增加筹码。”
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朝核问题的斡旋者（3）
一家媒体评论说，对韩国来说，最迫切的还不是核问题，而是朝鲜政权的稳定，即使不发生战争，如果外界逼压太甚引起朝鲜社会动荡，其产生的难民和经济问题也将给韩国带来灾难性后果。美国的战争准备及其对朝鲜毫不妥协的态度，让韩国人心惊胆战，认为这可能导致朝鲜铤而走险，危及韩国的利益和整个民族的未来。韩国此时提出“重大提案”，就是希望以“胡�