在刘少奇讲话时，毛泽东插话说：“我国出不出修正主义，两种可能：一种可能，一种是不可能。现在有的人三斤猪肉，几包纸烟，就被收买。只有开展社会主义教育，才可以防止修正主义。”
刘少奇的这个报告，于4月2日作为党内文件下发。
会后，城市中的“五反”运动试点工作开始。
会议期间，毛泽东向与会者推荐了两个报告：一个是湖南省在农村开展以抓阶级斗争为主要内容的社会主义教育运动；一个是河北省在农村中开展整风整社运动的经验。
显然，毛泽东意在督促各地注意阶级斗争和社会主义教育的问题。28日，毛泽东在会上强调说：“要把社会主义教育好好抓一下。社会主义教育，干部教育，群众教育，一抓就灵。”
这次会议后不久，刘少奇出访东南亚。在这期间，从5月2日至12日，毛泽东在杭州召集了一个小型会议，准备一个农村社会主义教育的文件。
毛泽东说，这个文件的“要点就是阶级、阶级斗争，社会主义教育，依靠贫下中农，四清，干部参加劳动这样一套”。
5月20日，中共中央正式发出了毛泽东主持起草的《关于目前农村工作中若干问题的决定（草案）》，即后来的《前十条》。
继城市中的“五反”运动之后，社会主义教育运动开始了。
对这次运动，毛泽东说：“这次是一次大考哩！”
但是，运动试点过程中，出现了一系列的新问题：打人现象层出不穷，乱“搜查”，重点“集训”，乱扣帽子，乱立“罚规”等。
9月，针对运动中出现的问题，中共中央召开了一次工作会议，总结前一阶段社会主义教育运动的经验教训，起草了《关于农村社会主义教育运动中的一些具体政策问题》（1963年9月中央工作会议纪要），即《后十条》。会议后半段，刘少奇出访朝鲜，没有参加。
10月25日，毛泽东起草了《关于印发和宣传“关于农村社会主义教育运动的一些具体政策问题（草案）”的通知》，要求将这个文件向农村全体党员和全体农民宣读，同时要向城市的一切人读。
10月31日，根据毛泽东的意见，刘少奇主持召开了中央政治局会议，讨论并通过了《后十条》草案。
刘少奇提议，将文件的名称改为《中共中央关于农村社会主义教育运动中一些具体政策的规定（草案）》。会议同意刘少奇的这一提议。
11月3日，刘少奇抵达杭州，出席毛泽东召集的小型会议。
在杭州，刘少奇同毛泽东就反对现代修正主义的斗争方法问题交换了意见，决定要采取两种方法：扩大宣传规模，改变过去只准《人民日报》和《红旗》杂志发表文章的做法，省级和中央一级报刊都可以组织文章，但要经中宣部、各大区批准；扩大传达范围，由过去只传达到党内17级以上干部逐步扩大到全体人民。
这是一个重大的改动：实际上刘少奇基本上已经放弃了他曾经力主的阶级斗争不要扩大化，要在小范围传达的主张。
这表明，刘少奇在思想上也发生了重大变化，同毛泽东保持了一致。
11月14日，刘少奇主持中共中央政治局扩大会议通过了《后十条》，随即由毛泽东签发全党。
《后十条》重申了要团结两个95％，强调团结95％以上的干部是团结95％以上群众的前提条件，对干部要一分为二，对犯错误的干部要以教育为主，区别阶级敌人同被敌人利用的落后群众，“四清”运动必须同生产结合，不能耽误生产。
但是，《后十条》基本上沿袭了《前十条》，有5个要点即阶级斗争、社会主义教育、组织贫下中农阶级队伍、“四清”、干部参加集体劳动，“在这5个问题中间，阶级斗争是最基本的”，“要以阶级斗争为纲”。
根据中共中央的决定，《前十条》和《后十条》“要使全国人民家喻户晓，做一次伟大的宣传运动”。
虽然在一定程度上纠正了运动前一阶段的乱打乱斗现象，但《后十条》与《前十条》一样，对形势的错误估计基本上保持不变，实际上再一次强调了“以阶级斗争为纲”。
在《前十条》、《后十条》两个文件的指导下，农村社会主义教育运动在1963年冬轰轰烈烈地在全国范围内开展起来。
社会主义教育运动在全国铺开后，从中央到地方的各级领导机关，纷纷抽调大批干部组成工作队下乡，指导农村的“四清”，并调查农村社会主义教育运动的情况。刘少奇支持毛泽东发动的这场旨在防止修正主义的运动。他先后派出自己身边的工作人员下乡参加“四清”工作队。王光美是刘少奇的夫人，也作为刘少奇办公室的秘书，第一批下乡。
1963年11月，王光美化名董朴，以河北省公安厅秘书的身份参加中共河北省委工作队，下乡到抚宁县卢王庄公社桃园大队，担任大队工作组副组长。刘少奇还派出其他几个秘书，甚至连自己刚刚参加工作的儿子刘允若也陆续下乡参加了“四清”工作队。
1964年春节，王光美回家过年。刘少奇向她详细了解了农村“四清”的情况，谈了自己的看法。
王光美说：群众反映一些犯严重“四不清”的干部同公社、县和地区的某些干部有牵连，在上面有“根子”。
刘少奇说：
犯严重“四不清”的错误，根子在哪里？封建势力和资本主义势力的腐蚀和影响是下面的根子，群众还提出有上面的根子，应该切实查一下上边的根子。上面的根子，包括上级机关的蜕化变质分子和一般干部的不好作风的影响。犯有严重“四不清”错误的干部，在上面大体都有根子。下面的干部给上面干部送礼物，请吃喝，甚至发展到互相勾结，上面就有人保护他了。很多事实表明，犯严重“四不清”错误的干部，如果没有上面干部的保护，就不敢犯那么严重的错误。
对这种情况，刘少奇说：“可以提挖上面的根子，这是群众提出的，是有事实根据的，要好好想一想。在什么时候提，什么时候往这方面引导，要看情况。现在就要搜集犯有严重四不清错误的干部同上面联系的材料。”
刘少奇之所以提出要“挖根子”，实际上与他对社会主义教育运动性质的判断有关。他认为是“四清”、“四不清”的性质，而不是毛泽东所说的是阶级斗争、敌我矛盾的性质。
王光美回河北后，向中共河北省委传达了刘少奇谈话的内容。后来在5月中央工作会议时，刘少奇将这次谈话的要点送毛泽东审阅。
王光美到下面蹲点搞“四清”，掌握的情况毛泽东也很注意听。
王光美后来回忆说：
我参加“四清”每次回北京，主席都问我很多情况，也不是专门的汇报，是在跳舞时谈的。记得第一次回来是12月（1963年），大约在中旬。在一次跳舞时见到主席。主席就问我，桃园是一类队，为什么群众有那么多意见呢？我说可能是上面人支持，还举了干部吃吃喝喝的例子。公社干部带着下面的干部吃，群众都说干部“吃懒了”。讲到这里，主席就说，根子在上面。回来后，我把同主席谈话的内容向少奇汇报了。
看来，刘少奇同王光美说的“挖根子”的问题，也是受到了毛泽东的影响。
于是，刘少奇在“四清”运动中，也逐步转向了“左”的一面：“挖根子”，“挖上面的根子”。
3月27日，刘少奇致信王光美说：“要团结95％的群众，也要团结95％的干部，这是运动和斗争达到的最终目的。要达到这个目的，不能不经过批评和斗争。对于那些违反人民利益、违反党的方针政策，只顾取得少数人的非法利益，而且坚持不改，并企图进行破坏的人，是不能不继续进行坚决斗争的。”
但是，没有多久，刘少奇就改变了团结两个95％的看法。
包括毛泽东、刘少奇在内，党中央领导人对形势的错误估计越来越严重，对运动中的方针政策也越来越“左”。
5月15日至6月17日，中共中央召开工作会议，讨论了农业规划和农村工作、第三个五年计划、政治工作等问题。
在会议上，一些人发言，提出了一些过火的不恰当的意见和措施，也包括刘少奇。
刘少奇首先提出了要修改《后十条》的问题：《后十条》强调发动群众不够，比较多的强调依靠基层干部，强调团结两个95％。于是，基层干部和那些“四不清”的干部，就拿团结两个95％来反对“四清”。
有人说：要在农村社会主义教育运动中“搬石头”，要在城市“五反”中划阶级。
6月2日，刘少奇主持了政治局常委、书记处书记和各中央局第一书记的会议，讨论社会主义教育运动问题。
刘少奇说：“和平演变”已经演变到高级机关中的某些人了，省委、市委都有他们的人。有些地方“四不清”干部对工作队的办法是“喂、顶、拖、混”，要想办法摆脱他们。他们抵抗“四清”就是“反党”，破坏就是“反革命”，要开除党籍。群众没有充分发动起来以前，不能强调团结95％以上的干部、依靠基层。
刘少奇提出，要“追”上面的“根子”。
6月8日，毛泽东召集了一个有部分政治局委员和各中央局第一书记参加的小型会议。
周恩来、彭真先后在会议上谈了运动中暴露出来的一些基层干部蜕化变质的材料。
毛泽东说：“总之，国家有l／3的权力不拿在我们手里；掌握在敌人手里，如白银厂、小站就是搞修正主义。中国出了修正主义，怎么办？”
按照毛泽东后来的判断，他认为是掌握在“走资本主义道路当权派”的手里。
说到这里，刘少奇插话说：“现在下边的问题就是不追上边，恰恰问题就出在上边。抚宁县的农民说，不仅下边有根子，上边也有根子。朝里有人好做官。