夜深了，难辨道路。贡闵保护着天子和陈留王借着萤火虫的微光向南行走。走了几里之后，兵士们发现了一辆老百姓用的板车。他们把受了惊吓又困得要命的天子和陈留王放上车，推行到洛舍，贡闵下令休息。天子哭闹着要找母后，贡闵束手无策，倒是陈留王安慰了哥哥几句，天子这才睡去。
次日天明，贡闵找来两匹马，让天子独乘一匹，自己抱着陈留王共乘一匹。到了北邙山南面的山坡下，终于见到前来迎驾的公卿大臣们。第一个上前参见的是故太尉崔烈。
突然，西边传来军号和马蹄声，滚滚尘土中，不知来了多少兵马。天子又吓得啼哭起来。公卿及兵士们也很紧张。
旌旗开处，董卓高大肥硕的身影出现了。他驰至近前，滚鞍下马，朝着天子走来。
天子哭得更凶。一个大臣上前拦住董卓，喊道：“有诏却兵！”
董卓将他拨到一边：“诸公身为国之大臣，不能匡正王室，致使国家播荡，却什么兵？”
崔烈上前呵叱道：“董卓回避！”
董卓大怒，指着崔烈的鼻子吼叫：“我等昼夜兼程，行三百里而来，你竟敢说什么回避？看我不能断你们的头！”
董卓凶神恶煞的样子和他身后的刀光剑影，把众人都吓住了。
董卓走到天子面前，天子见他一脸横肉和虬髯，脸都白了。董卓说：“下臣甲胄在身，不行大礼了。陛下到了这一步，都是因为您让诸常侍和小黄门胡作非为，以取祸败。陛下责任不小啊！”他又问天子出城的经过，天子面色迷惘，语无伦次。
董卓又走到陈留王面前，脸色和悦了许多，他张开手臂：“在下便是董卓，让我来抱你上马。”
陈留王比天子要镇静得多，他也不回答，任凭董卓将他抱上马。一路上，董卓问他这两天的经历，陈留王一一为之叙述，董卓笑着说：“王爷幼而聪慧，令下臣钦佩。下臣听说，王爷是董太后带大的，下臣也姓董，论起来，也可以算是太后的同族吧！”
大队人马开进了京师。天子一回宫，朝廷下了大赦令，改元昭宁。命武猛都尉丁原为执金吾，掌典禁军。拜董卓为司空。在检点皇家法物时，发觉传国玉玺丢失了。
这时，鲍信招募的兖州兵马也开至京师，他见董卓带来了兵马，便去找袁绍说：“董卓拥强兵，必有异志。今不早图，必为所制。可趁其新至疲惫，突然袭击，一举可擒！”
袁绍沉吟不决。鲍信见势不妙，带着兵马回兖州去了。
董卓虽然粗野，但不乏智谋。他带进京师的步骑不过三千，一入城，他就收编了何进、何苗的部曲。为了让京师的公卿乃至禁军们慑服，他密令部下在夜里悄悄出城，第二天大张旗鼓地入城，就这样连搞了好几天，京师的人不知道来了多少西北军。
西北军的军纪让京师的百姓们心惊胆战，无论是汉人军士，还是羌胡军士都喜欢抢劫、杀人、奸淫。
九月五日癸酉，董卓大会公卿。他昂着头说道：“皇帝？弱，不可以奉宗庙，为天下主。今欲依伊尹、霍光故事，更立陈留王，众卿以为如何？”
大殿上鸦雀无声，无人敢出来言语。
“当初霍光定策，延年按剑，有敢违抗大议者，皆以军法从事！”
大殿上又回响起董卓恐怖的声音。
可是，卢尚书站了起来：“从前太甲既立，昏昧不明；昌邑王罪名过千百，故而有伊尹、霍光废立之事。当今天子富于春秋，行无失德，不可与前事相比！”
董卓的脸上显出怒容：“罢了他的座，拉出去斩了！”
兵士们进来，将卢植拖了出去。
侍中蔡邕进前：“将军息怒。卢尚书和将军一样，皆是为匡正汉室。如将军一怒而诛之，天下人岂不误会将军的一片忠心？”
蔡邕怎么会出现在这里呢？原来董卓在进军京师之际，就打算组织一个新的朝廷。他也知道必须找一些名士来作点缀。他派人去找亡命在南方的蔡邕，蔡邕说：“我老而且病，就不去领董公的情了。”
董卓让人传话给蔡邕：“我喜欢灭人九族！”
蔡邕怕了，他在董卓进京前就赶到了京师。董卓见到他，大喜过望，三日之内将蔡邕从御史升至尚书，又从尚书升到侍中。蔡邕这次回到阔别已久的京师，还带来了爱女文姬，她现在已不再待字闺中，而是一个回到老父亲身边的寡妇了。
继蔡侍中之后，议郎彭伯也对董卓说：“卢尚书海内大儒，人之望也。将军今天杀了他，可能会引起天下震怖。”
董卓听明白了，他马上让人放了卢植，但免去官职。
次日，卢植上书请求退休回乡。到了家乡涿郡，他让家人继续北上，直至外长城脚下的上谷。董卓果然派出了人马追至涿郡。三年后，卢植病故于上谷，临终前，遗令以单帛裹身，埋入土穴，不用棺椁。
会后，董卓将会议记录送给太傅袁隗审阅，太傅批道：依将军所议。
当天，董卓又请袁绍来府中议事。董卓说：“天下之主，应该是贤明之君。每每想起灵帝，令人气愤！陈留王看起来似乎比天子强些，我想立他，您看如何？人总有小智大痴之处，也不知陈留王到底怎样，姑且就先立他为帝吧，刘氏的种，不值得再留存了！”
袁绍回道：“汉家君临天下四百多年，恩泽深厚，兆民拥戴。天子富于春秋，未有不善之举宣于天下，公今欲废嫡立庶，恐众臣不从公之议也。”
董卓听了，按剑而起：“竖子竟敢如此？天下之事，岂不在我？我欲为之，谁敢不从！你是不是觉得，我董卓的刀不够快？”
袁绍不愧是条汉子，他也勃然大怒：“天下的豪杰，难道只有董公一人？”说罢，袁绍拔出佩刀，横在前胸。董卓的卫兵不敢贸然上前，袁绍大步而出。
袁绍知道董卓新至京师，自己又是大家之子，一时不敢加害，但时间久了也不是个办法。他将自己的司隶校尉印绶挂到京师的上东门，逃奔冀州而去。
前天，董卓就觉得，京师之中惟一还握有重兵的公卿，就是执金吾丁原。他得想个办法。
丁原手下有个出名的猛士叫吕布，此人字奉先，出身寒门。丁原在并州刺史任上时，提拔他做了骑都尉。吕布为人粗疏，识字又不多，但膂力过人，骑射出色，人称飞将，加之他有一匹少有的良马，名曰赤兔，民间顺口溜都说：“马中赤兔，人中吕布。”丁原对他信任异常，他成了丁原军队事实上的统率。董卓决定从他下手，因为他认定这样的粗人没有政治远见，稍以荣华富贵引诱，即可上钩。
没有想到如此之快，袁绍刚走，吕布就带着丁原的人头来见董卓了。董卓和他拉着手，认了义父义子，拜为中郎将，封都亭侯。吕布从此执了他的长戟，跟随董卓左右，成了他的卫士长。
董卓的胆子更壮了。第二天，九月六日甲戌，董卓会群臣于崇德前殿。公卿们进宫之际，发现宫中各门，均由董卓的人马把守，心中怦怦直跳。进了崇德殿，看见太后、天子、陈留王都在，大家知道，今天必有大的不幸。
董卓站到御座前，大声宣布：“皇帝在先帝丧服期间，无人子之心，威仪不类人君。今废为弘农王，立陈留王协为帝！”
说罢，太傅袁隗将陈留王扶上御座，亲自解下天子的印绶，奉于陈留王。又扶弘农王下殿，北面称臣。
两个同父异母的兄弟，在这上下易位之际，都成了懂得世事的成人。
何太后哽咽不止。公卿们目视袁隗。袁隗不敢抬头，袁氏累受皇恩，世代公卿，却做出这种丧失气节之事，太没有面目了。
董卓又宣布：“太后逼迫永乐太后，违背妇姑（婆媳）之礼，迁永安宫居住。”
新天子下诏：“赦天下，改元永汉。”
九月八日丙子，何太后被迫喝下一杯毒酒身亡。董卓声称太后暴病，会葬之时，又令公卿不得穿丧服。接着，杀太后之母舞阳君，发何苗棺椁，弃尸道边。
九月十七日乙酉，诏发幽州，以太尉刘虞为大司马，封襄贲侯。诏出，即拜董卓为太尉，封噤侯，加节传、斧钺、虎贲，这是一个规格相当高的仪仗。
尚书、武威人周毖和城门校尉、汝南人伍琼进见董卓，劝他矫正桓、灵之政，擢用天下名士；以收众望。这很合董卓的意思，他一直在准备做新的天子，知道收拢人心的作用。
二十六日甲午，董卓率诸公卿上书，为陈蕃、窦武及死难的党人平反，复其爵位，遣使吊祠，擢用其子孙和门生。
十一月，以董卓为相国，这是大汉初年的重爵，是一个终身职位。天子又下诏：董相国赞拜不名，入朝不趋，剑履上殿。诏除光熹、昭宁、永汉三个年号，仍称中平六年。
十二月，任命司徒黄琬为太尉，司空杨彪为司徒，光禄勋荀爽为司空。杨彪字文先，杨震的曾孙。黄琬字子琰，其祖父黄琼为孝桓皇帝朝的司空，也是大汉的名臣。其他被董卓擢用的名士还有：郑泰，任尚书。何锸，任长史。陈纪，此人是陈？之子，拜五官中郎将。韩融，拜大鸿胪卿。韩馥，原尚书，拜冀州牧。刘岱，原侍中，拜兖州刺史。孔佃，拜豫州刺史。张邈，拜陈留太守。张咨拜南阳太守。只有一个申屠蟠见诏大笑，就是不来京师。
董卓进京后，公卿大臣的委任都从旧官僚或名士当中选拔，西北军的将校们和他的亲信并没有大加重用。董卓也知道，这些人只能用作犬马驱使，不可委以治国大任。
曹操接到了董卓的任命，让他做骁骑都尉。曹操马上变易姓名，逃向东方。可董卓的追杀令更快，到了中牟，曹操被小吏逮捕。他咬紧牙关，不承认自己是曹操。中牟的功曹认识他，便对中牟令说：“曹操我见过，不是此人。”
曹操回到家乡，散财募兵，以图大事。
次年正月，改元初平。�