的同意。不过他以后却至少克服了这种困难的一部分。
1571年，约翰还只有26岁。说起来也许太巧合，阿贝拉会战时的亚历山大，在西班牙就任总司令的汉尼拔，和在洛迪会战中的拿破仑，也都是26岁。他不仅英勇过人，而且虽然年轻，也是一个具有磁力的领袖。梅里曼说：他似乎使教皇的十字军精神人格化了，他的热忱能感人，使人暂时忘记了一己的私利，而为公共的目标牺牲。他似乎是1095年的化身。
最后在1571年3月7日，当会议已经快到最后决定阶段时，西班牙的首席代表格兰维利大主教（Cardinal Granvelle）又提出了新的难题。这未免使威尼斯政府感到太灰心了，于是它派了一个使臣拉格佐尼（Jacopo Rag…azzoni）到君士坦丁堡，希望能与土耳其人媾和。他于4月26日到达，谒见了大宰相，可是对方却不肯让步，坚决要求无条件投降。他说：“和平对于你们是比战争要好。你们不能与苏丹相对抗，他不仅会占领了塞浦路斯，而且连其它的领土也难保。至于说到你们的基督教同盟，我们完全知道那些基督教君主对于你们是毫无好感的。不要相信他们，假使你们能够附着苏丹的‘骥尾’，则你们在欧洲即可以为所欲为，并享受永久的和平。”听了这一番富有诱惑性的说辞，拉格佐尼就回国去了。但是当他尚未到达意大利之前，神圣同盟却已经宣布成立了。这是5月25日的事情；所以谈判遂中断。
这个著名的条约也是后来许多条约的始祖。其重要的条款如下：这个同盟为永久性的，不仅是为了对付土耳其人，而且也同时以阿尔及尔、突尼斯和提波利为对象。同盟的军力定为桨帆战舰二百艘，其它战舰一百艘，步兵五万人，轻骑兵四千五百人，和大量的火炮。三个月间均应准备就绪，以便开往地中海滨海地区，或作其它的远征。当受到土耳其攻击时，各盟国有协防的义务。战费的一半由西班牙担负，其余一半的三分之二由威尼斯担负，另外三分之一则由教皇担负。在指导战争时，三国的总司令都有其独立的发言权，但对于已经决定的计划，其执行则由统帅负责。皇帝、法国和波兰的国王可以有加盟的权利，但对于英国女王（伊莉莎白）则未提及，因为她不是天主教徒。一切所征服的领土均应照事先约定的方法瓜分，但阿尔及尔、突尼斯和提波利则完全保留给西班牙。同盟国间若发生了争执，由教皇任仲裁人，在未经全体同意之前，任何国家都不得与土耳其缔结休战、和平、和同盟性的条约。
尽管有了这些条款，可是意图还是与决定发生了冲突。威尼斯希望利用同盟来夺回塞浦路斯，并击毁奥斯曼帝国在地中海东部的权力。菲利普二世则希望击毁其在地中海西部的权力，并肃清回教徒的海盗。他们虽然都加入了同盟，但彼此间却仍然是互相猜忌。只有教皇一个人是专心一志，并且充满了热忱。他具有大一统的观点，认为整个基督教世界都遭到了威胁，而不仅是西班牙和威尼斯的私事。这个同盟的成立，以及后来的成功，都应归功于庇护五世一人，因为他是它的心脏和灵魂。
6月6日，约翰从马德里出发，于16日到达巴塞罗纳。他发现安德拉德（Don Gilde Andrade）的舰队已经集中在那里，就命令留在卡塔基纳（Cartagena）的圣克鲁兹侯爵（Marquis of Santa Cruz）去加入在一起。20日由巴塞罗纳出发，26日到了热那亚，在那里又与热那亚海军将领多里亚（Andrea Doria）的舰队会合了。8月2日航到了斯佩齐亚（Spezia）去装载部队，然后于9日投锚在拿波利。在那里，格兰维利大主教把同盟的战旗授给他。早在热那亚，他已经接到教皇的一封信，劝他不顾一切冒险一战。
在拿波利花了十天的时间来讨论计划和搭载部队，于8月20日才启程前往墨西拿，这是指定的集合点。当约翰于23日下午到达该地时，他与教皇的海军将领科伦纳、威尼斯的海军司令，75岁的费尼罗（Sebastian Veniero）会晤了。前者于7月21日，后者于7月23日到达。
此时在君士坦丁堡的塞里姆因为得到了尼科西亚而大喜过望，认为先知者的预言就可以实现了：土耳其人即将统治一切的地中海岛屿，圣彼得大教堂马上就会和圣索菲亚一样了。他以空前的决心来推进对法玛古斯塔的围攻，四月间他命令阿里（Ali Pasha）把舰队集中在尼格罗蓬特（Negropont）以来拦阻企图救援塞浦路斯的同盟舰队，同时也给法玛古斯塔的的陆军以强大的增援。
快到五月底的时候，土军对法玛古斯塔重新展开炮击，并且在护城河边获得了一个入口。同时也尽量使用地雷，利用一种叫“提查”（Tezza）的植物来燃烧，以便发出毒烟把守军熏出来。七月底，守军死了一半，火药已经用完，为了使该城免于遭劫起见，威尼斯主将决定作有条件的投降。穆斯塔法立即允许，于是8月1日该城投降。四天之后，穆斯塔法要求人质，因为这是降约上所未有的，威尼斯人拒绝交出；他就把巴格利昂和其他的高级军官杀死，但布拉加迪诺则保留下来以供施行毒刑。首先割去他的鼻耳，再活剥了他的皮，用稻草塞在皮里游街，以后更把它送去君士坦丁堡，作为奴隶市场中的装饰品。其他的降卒都发配为摇船的奴隶。圣尼古拉大教堂被夷为平地，所有的基督徒坟墓都被掘发；但是在这次围攻中土耳其人却付出了极高的代价，据说损失了五万人。
因为同盟军并未作救援法玛古斯塔的企图，阿里遂从尼格罗蓬特扬帆，蹂躏了在摩里亚的威尼斯领土，和查提（Zante）及凯法洛尼亚（Cephalonia）等岛屿，并在科孚（Corfu）岛登陆，但被击退，于是从那里又航向达尔马提亚海岸，在威尼斯咸水湖的外面出现。没有一艘战舰来抵抗他；不久以后，当他知道联军舰队集中在墨西拿时，就害怕会被封锁在亚德里亚海之中，于是又转回去向科孚岛进发。他感到很满足，因为他觉得自己已经使敌人受到了最大的损害。
当盟军在墨西拿集中之后，约翰发现他一共有三百艘船只，八万名人员——其中三万人为陆军，五万人为海军和摇桨的奴隶。海军舰队的实力如下：西班牙舰队为战舰90艘，爆击舰24艘，小型舰船（Brigantines and Frigates，袭击舰和护卫舰）50艘。威尼斯的舰队为战舰106艘，巡察舰6艘，爆击舰2艘，小型舰船20艘。教皇舰队为战舰12艘，小型舰船6艘。一总说来，一共有208艘桨帆战舰（Galleys），后来又加上了17艘；6艘巡察舰（Galliasses）；26艘爆击舰（Galleon）和76艘小型舰船，总数为316艘。当发现威尼斯舰队缺少人员时，约翰就命令把意大利兵2500人和西班牙兵1500人送去补充他们。费尼罗勉强接受了他们，因为这可能引起争吵。
因为常常发生争吵，纷扰无穷，约翰面对着许多的困难，遂采取快刀斩乱麻的手段，以求一劳永逸的解决。他将他的部队作彻底的改组，把各国的人员绞合在一起，这样不仅使各位将领不能单独撤退他们的船只，而且减弱他们的权威，也就无异于提高了他自己的权威。这样就可以不再受到原有的限制了。
除指定克尔格尼亚（Ade le Corgnia）指挥陆上兵力以外，他把各国的海军集中在一起，像陆军一样分为三个战术性区分——中央、右翼和左翼，另加一个前卫和后卫。中央共有64艘战舰 ＇ 注：扫校者注：插蓝色三角长旗 ＇ ，在他自己指挥之下，由费尼罗和科伦纳协助之。右翼为54艘战舰 ＇ 注：扫校者注：插绿旗 ＇ ，由多里亚指挥，左翼为53艘战舰 ＇ 注：扫校者注：插黄旗 ＇ ，由威尼斯的海军将领巴尔巴里哥（Augustino Barbarigo）指挥。前卫一共8艘战舰，由西西里将领卡尔多拉（Don Juan de Cardona）指挥。后卫共30艘战舰，由克鲁兹侯爵指挥。6艘巡察舰以一对为一组分配给三个区分。爆击舰和运输舰另组一个支队，它们完全依赖风帆航行，机动性较差。小型船舰则分别配属各区分，并奉命在后面航行。
9月10日，举行了一次作战会议。科伦纳和费尼罗主张立即进攻，多里亚和克尔格尼亚则主张再延迟。但是约翰早已立下了决心，主张进攻。于是骰子掷下去了——这是一个决死战。所有的反对都结束了，教皇的使者宣布举行誓师典礼，以上帝的名义鼓励大家雪耻奋斗。
9月15日，笨重的爆击舰也从墨西拿航出，桨帆战舰于次日跟上。十天之后到了科孚岛，才知道阿尔及利亚海盗头子乌尔齐·；阿里（Ulchi Ali）所指挥的土耳其舰队曾经攻击该岛，但未能攻占要塞。从俘虏口中，约翰得知乌尔齐已经撤往勒班陀（Lepanto），它的位置在科林斯湾（也称勒班陀湾）中。
因为这是一个重要的情报，所以约翰立即召集了作战会议。经过相当的反对，他决定了立即前进，设法引诱敌人出战。这个决定是够勇敢的，因为不仅苏丹的舰队控制着地中海，而他的陆军也比同盟方面远占优势，所以若是海军战败了，则一定会导致全面的入侵。诚如斯特林·；马克斯维尔（Sir Sterling Maxwell）所说的，很明显地，只要有一个错误的行动，结果即将铸成大祸，而使欧洲陷于亚洲强大征服者的脚下。但是反而言之，若是采取懦弱的政策，以求避免大祸，结果也还是一样的危险。因为同盟即可能瓦解，这些国家单独的海军则更不是苏丹的对手。事实上只有攻势才能使这个同盟不至于瓦解。这就是问题的核心。
9月29日，约翰率领了他的中央兵力，直向阿尔巴尼亚海岸上的哥米尼查（Gomenizza）进发，在那里遇到前卫支队的一艘小船，知道不仅乌尔齐在勒班陀，而且阿里的二百艘战舰也停泊在那里。约翰不等爆击舰赶上，就命令在科孚岛的费尼罗和科伦纳以全速和他汇集在一起 ＇ 注：扫校者附注：科孚