军政府成立后，以孙大元帅名义通电否认冯国璋为总统，宣布段祺瑞等为叛逆，下令北伐，发动了护法战争，四川、湖北、陕西、浙江、湖南、安徽等省宣告独立，在短短几个月内，护法的烽火遍及十几个省份，〃纵横于大江南北，如火如茶，一日千里，皆以拥护军政府为名〃，只可惜以你为名可以，受你管辖的不干。一群地方军事割据势力借“护法”之名，对抗中央政府，也许有维护正义的成分，但巩固自己既得利益也是必须考虑的原因之一。孙中山曾计划把各地的护法力量纳入军政府的统一指挥之下，但根本没人听你的【注24】，自己坐在总统府起草命令，起草完后发出去，辗转各个渠道，但殊途同归，都进了废纸篓。再说这老百姓，哪里懂得什么独裁与民主、专制与共和啊，讲那大道理谁明白啊，国会解散与否与我们何干啊，我们只知道有皇帝的时候，哪怕皇帝是个三岁顽童，我们顶多是受受洋人的欺负，国内大部分地方还是太平的，可自从你们搞了个什么“辛亥革命”之后，今天换总理，明天换总统，间或还蹦出俩皇帝，这中华民国已经六年了，天天你打我、我打你，就没消停过，你们有完没完呐。
孙中山此时的处境无疑是尴尬的，在军界，他始终没有威信，没有当年袁世凯坐镇，四海宾服的气势，而在民心思定普通百姓中间，其威信也因一次次的发动战争而降到了冰点，那么单靠极少数的知识分子精英层的支持，想把握住纷乱的中国政局，实在是有心无力。
人家陆荣廷不光不接受元帅的任命，还公开说，“自无另组政府之必要”，“以后广东无论发生何种局面，概不负责”【注25】，意思就是说，咱们护法就护法，你另立中央我是不同意的，唐继尧虽然没有陆荣廷说的这么直接，但不听你号令不受你节制是旗帜鲜明的。你自称代表中华民国，可老百姓不认可你代表，军队不服从你领导，其它国家有什么外交上的问题也不找你，国会代表开会选你吧，还不够法定人数，不光两个元帅没就任，分封了一通部长，只有陆军总长张开儒一个人上任，这使得孙中山军政府的合法性遭到了广泛的质疑。
你这边风风火火的搞自治，我就堂而皇之的出兵镇压，段祺瑞不顾代总统冯国璋的反对，当即决定向南军发难，武力统一。这可好玩了，南方打的是“护法”的大旗，宣称是真共和讨伐伪共和之战，这其中分两派，一派是孙中山所代表的精英知识分子群体，希望恢复张勋复辟前的国会，那个国会里，国民党占了绝对优势，后来这些人很多加入了中华革命党，如果成功，孙中山是有可能借国会之力取得国家领导权的，这是合理合法的，因为当初宋教仁领导国民党时，这些议员们可是民主选出的，凭借合法的手段实现权力，本就是民主的一大特色，所以孙先生如果真的寄希望于通过恢复国会而取得国家领导权，完全正确，无可厚非，只不过想的天真了些。另一派是陆荣廷、唐继尧所代表的军阀割据势力，他们对国会啊共和啊也没有什么特殊的好感，只不过拉大旗作虎皮，为自己继续保有护国战争时攫取的既得利益才是真的。北方打的是“统一”的大旗，宣称是平灭反政府割据势力，而北方在“统一”大旗下，又分两派，一派是携皖系而自重的总理段祺瑞，执意“武力统一”，就你们南方那点兵那点将，竟然胆敢向我强大的北洋军叫板，我直接平了你就算了。另一派则是直系领导人代总统冯国璋，主张“和平统一”， 咱们安抚一下南方各派，求同存异，不要动不动就拿刀动杖的，小心眼就是，你段祺瑞如果真三下五除二把南方给剁了，你的势力得多大啊，我将何处容身啊。
在各怀心腹事的氛围当中，南北战争开打了，战场湖南，陆荣廷、唐继尧虽然不听总统府号令，但北抗段祺瑞还是有共识的，现在的桂系，滇系已经具备了一定实力，并且是在保卫自己的胜利果实，因此打的比较坚决，而北洋军则不同，想当年袁世凯掌权南北议和的时候，那是铁板一块，令行禁止，可老袁一去，现在的北洋是直、皖、奉三大系加若干小系，各打各的算盘，想再拧成一股绳，已经不可能了。段祺瑞以陆军总长身份直接指挥“武力统一”，他命令直系部队打头阵，这也太明显了点，消除异己也得稍加掩盖啊，冯国璋能干吗？南北两军没打两下，直系的王汝贤、范国璋两个师就罢兵不打了，不光不打，还发表通电，反对内战，主张“和平解决”，多么冠冕堂皇的理由啊，立马就得到了人民的支持，老百姓管你什么“护法”还是“统一”，谁主和老百姓就拥护谁。段祺瑞派去的湖南督军傅良佐见势不妙，抽身逃走了。护法军乘势向北推进，竟然旗开得胜，直系公然的不合作态度，令段祺瑞手忙脚乱，紧接着南方护法军在四川湖北相继取得了胜利。段祺瑞知道自己被直系给算计了，怒不可遏，找到冯国璋，我是责任内阁总理，却不能行使权力，作为陆军总长却不能指挥军队，我不当了，你另请高明。冯国璋一听，好啊，那就接受你的辞呈，请王士珍继任总理兼陆军总长，然后高举“南北和谈”的大旗，下令南北停战议和。孙中山看见南军获胜，甚是高兴，命令前敌各军乘胜前进，务求“护法”之完全胜利，“舍恢复约法及旧国会外，断无磋商余地”，在大总统已经下令北军停战的情况下，依然叫战不止，置民众于水火之中，必然得不到百姓的支持，其次他都忘了自己的光杆大元帅的身份了，人家前敌众将真正的目的只是保存实力、保住地盘，那个《约法》和国会和这帮军人实在没太直接的关系，最重要的一点，此次南军的胜利只不过是因为北军产生内耗而已，并非是你有能力打败北军，现在人家跟你讲和，给你下台阶，你还不马上接着，再往北打，把冯国璋惹急了，劈头盖脸把你揍一顿，那可就连这点家底都赔进去了。所以陆荣廷和唐继尧根本没把孙中山的命令当回事，马上附和了冯国璋的停战命令，大家各自停手。
这孙中山想打，可人家不理他，他还就没办法。段祺瑞就不同了，敢给我下拌子，以为我段祺瑞不当总理不当总长，就奈何不了你们了吗？在段祺瑞及其心腹大将徐树铮的策动下，吉、黑、奉、直、鲁、晋、陕、豫、甘、新、皖、浙、闽13省督军代表分别于1917年12月2日和1918年1月5日，连续召开两次天津会议，强烈要求冯国璋明令讨伐西南，南方这帮小子明显是不把中央政府放在眼里，如果他们举兵反抗政府都得不到严惩，国家还有希望吗？看见没有，这就是当时的实际情况，从总统到各地方领导，全部是军人，而且是实权派军人，商讨什么事不用国会了，就用督军团，大家可以辩论，但最后听谁的，主要还是看谁枪多。冯国璋一看这架势，心里也害怕，这么多人都反对我，万一兵变了可咋整，那可真是国将不国了，督军团想打那就打吧，人民反对内战？人民和督军比起来，算个屁啊。然后找到段祺瑞，哥们儿，你看看，你一辞职这国家就乱了，这南方平乱的事啊，还得你负责。18日任命段祺瑞为参战督办，皖系干将段芝贵为陆军总长，让皖系重掌中央军事指挥大权。这次是直系皖系一起出手，直系曹锟与皖系张怀芝分任一、二路军总司令，战事一直打到了第二年也就是1918年春天，南军已经被打的丢盔弃甲。这曹锟手下有一员大将叫吴佩孚，署第三师师长，此人乃北洋军中的后起之秀，当了急先锋，率兵直进，连克岳阳、长沙、衡阳诸城，可以说在攻占湖南的战斗中战功最为卓著，可人家段祺瑞将湘督兼省长一职授予皖派嫡系张敬尧，使曹、吴大为不满，吴佩孚在占领衡阳后即停步不前，不打了。曹锟更绝，5月底，直接班师回了天津。6月15日直系与桂系代表签订停战协定，息战言和。8月，吴佩孚通电主和，公开攻击段祺瑞的武力统一政策“实亡国之政策”。直系将领纷纷响应，这仗还就打不下去了。8月下旬段祺瑞被迫命令前线各军暂取守势。
这边冯国璋和段祺瑞勾心斗角，那边滇、桂军阀也没闲着，要好好解决孙中山的问题，你无兵无饷的，老老实实在总统府喝茶看报纸不就完了，可你老把自己当回事，老想命令我们，可你那一套在现实中能行的通吗，让我们北伐，还没打人家呢，就被人家打的屁滚尿流了，我们是不能跟着你混了，你也别在那宝座上给我们添乱了。先是桂系发起，由国民党稳健派人士出面，正式提出改组军政府的主张，并拟定《中华民国军政府组织大纲修正案》七条，说咱们也别来大元帅单独首领制了，咱们实施若干总裁和议制，这比较民主，对吧？滇系唐继尧当即通电表示支持这一主张，并声称我们应该遥戴黎元洪或者冯国璋为为大总统，推岑春渲为国务总理，至于孙中山，“则宜游历各国，办理外交”，意思是你哪凉快哪歇着去吧。1918年5月4日，非常国会召开，孙中山和中华革命党议员虽然坚决反对，但仍然无法获得议会多数，非常国会通过了《修正军政府组织法案》。当日孙中山即向非常国会提出辞呈，并发表大元帅辞职通电。他在电文中回顾护法以来的艰难历程，愤然指出：“顾吾国之大患，莫大于武人之争雄，南与北如一丘之貉。虽号称护法之省，亦莫肯俯首于法律及民意之下。……”20日非常国会选举唐绍仪、唐继尧、孙中山、伍廷芳、林葆怿、陆荣廷、岑春煊七人为政务总裁，以岑春煊为主席总裁。改组后的军政府完全由桂、滇军阀及政学会所控制。
孙中山于次日离开广州，前往上海，护法运动宣告失败。
实在不好意思，毕竟写字不能换来饭前，所以这几天忙于工作，来不及更新，今天晚上本想多写些呢，可是却是十分的疲乏，完全不在