土肥原贤二、桥本欣五郎、俊六、平沼骐一郎、广田弘毅、星野直树、板垣征四郎、贺屋兴宣、木户幸一、木村兵太郎、小矶国昭、松井石根、松冈洋右、南次郎、武藤章、永野修身、冈敬纯、大川周明、大岛浩、佐藤贤了、重光葵、岛田繁太郎、白鸟敏夫、铃木贞一、东乡茂德、东条英机、梅津美治郎。
起诉书认为，从1928年1月1日到1945年期间，这28名被告支配和领导了日本的对内外政策。
在对内政策方面，被告有组织地向日本国民灌输民族优越感，在政治上把和纳粹党或法西斯党一样的组织纳入日本议会中，用作为侵略服务的工具；在经济上，把日本的大部分资源用于战争目的；加强陆海军对政府的威胁和压迫，创设翼赞会，倡导国家主义的扩张政策；对报纸广播严加管制，在精神上把国民舆论引向侵略战争。
第六部分落太平洋（6）
在对外政策方面，被告和纳粹德国和法西斯意大利统治者一起共同策划由侵略性国家对世界进行统治和剥削压榨。计划、准备并开始实行对各和平国家的、违反国际法及条约的侵略战争。
另外，被告在挑起世界性纠纷、发动侵略战争的同时，违反战争法规，虐待俘虏并屠杀一般民众。
5月3日上午10点，远东国际军事法庭正式开庭。28名被告被带上被告席，以韦伯为首的法官们、以基南为首的检察官们、以穗积重威和清濑一郎为首的辩护律师们各就各位。在起诉书的朗读声中，长达两年多的东京大审判正式拉开了帷幕。
6月，检察方面开始立证。1947年1月，开始由辩护方面辩护。此后，再由检察、辩护双方进行辩论，检察方面进行最后论罪求刑，辩护方面进行最后申述。直到1948年4月16日，审理才告结束。在此期间，大川周明因发疯被送往精神病院，永野修身和松冈洋右因病死亡。
1948年11月4日，韦伯审判长宣读了对25名甲级战犯的最终判决。东条英机、广田弘毅、土肥原贤二、板垣征四郎、木村兵太郎、松井石根、武藤章等7名被告被判以绞刑，东乡茂德被判以有期徒刑20年，重光葵被判以有期徒刑7年，其余16名被告都被判以无期徒刑。
远东国际军事法庭对日本甲级战犯的审理及判决，无疑反映了全世界广大爱好和平的人民的心声，是对日本军国主义分子们的严厉打击。它的正义性和进步性理应得到充分肯定。但是，由于战后国际局势的变化，被美国控制的国际检察团没有充分的时间去发掘更多的证据，因而在具体量刑上存在着少许的偏颇之处。极为明显的是，法庭仅仅将审判矛头对准了执行天皇命令的法西斯军人和少量文官，而对拥有发动战争权力的天皇的责任避而不谈。更令人气愤的是，盟军不仅陆续释放了28名甲级战犯以外的全部战犯嫌疑人，而且还将被判有期徒刑和无期徒刑的18名甲级战犯在几年后予以释放。这就是说，对“九·一八事变”、“七· 七事变”和太平洋战争承担罪责的只有被判处绞刑的7个人。而那些被释放的人，在不久后《旧金山和约》生效即日本获得独立时，立即受到关照，被解除整肃，重新在政界、财界和舆论界活跃起来。
东京大审判似乎给后人留下了虎头蛇尾之感。
制定新宪法要想彻底埋葬军国主义化的旧日本，创造一个民主化的新日本，除了消灭旧时代的遗迹、采取许多革新措施以外，最重要的是，要在国家根本大法——宪法中把所有改革措施固定下来，使一代又一代的日本人按照宪法规定的方向下去。
麦克阿瑟在这方面立下了不小的历史功绩。他敏锐地抓住了修改宪法的核心问题，即天皇制问题。由于美国政府在战后初期对日政策中规定要利用天皇制达到改造日本的目的，因此，麦克阿瑟在苏、中、澳等国舆论要求追究天皇的战争责任时，以强硬的态度拒绝了这种要求。但是，在另一方面，为了把具有古代神权和近代绝对主义双重性质的天皇制改变为象征性天皇制，麦克阿瑟做了大量的工作。
首先，为了破除笼罩在天皇制周围的神秘气氛，麦克阿瑟决定拿作为日本国教的神道教开刀。神道教系从日本原始宗教发展而来，最初以祖先崇拜为主要内容，信仰多神，特别是作为太阳神的皇祖神——天照大神。自从天皇被认为是天照大神的后裔并是其在人间的代表后，神道教便有了特权，皇统成了神统，即所谓“神皇一体”、“祭政一致”。特别是明治政府独断地规定了神道的“非宗教”性，从而使它获得了国家大量的援助和特权。日本军国主义分子利用神道教鼓动极端国家主义狂热情绪，鼓吹以日本为中心，建立以神道教为统治思想的 “大东亚新秩序”，并宣称每个臣民一生中的最高目标就是为天皇效忠至死，死后便可以成神。正是在神道教的欺骗下，日军官兵才在对外侵略战争中表现得极为疯狂，令西方人难以理解。日本统治阶级也正是利用这种疯狂，达到了他们维护天皇制的目的。
美军占领日本后，自然不能允许神道教的特权继续存在下去。1945年12月10日，盟军总司令部颁布了《废除政府对国家神道和神社神道的保障、支援、保全、监督及传布》的指令。具有彻底性和革命性的该指令明确指出：崇拜神社是为侵略、军国主义和极端国家主义提供思想基础，所以要取消国家和自治体给予神社的一切特殊待遇和援助，并规定不能在国家的援助下传布教义和举行祭典。为此，命令伊势神宫与国家脱离，解散内务省神NFDC8院，废除研究神道和培养神官的国家机关，国立和公立学校与神道分离，删除教科书中的神道教义，禁止国家的教育机关参拜神社，禁止政府的教育机关和学校设神龛、挂天皇御照，禁止因不信仰神道而受歧视，禁止官吏以公职身份参拜神社（明治以来，新任职的大臣和地方政府知事都必须到伊势神宫、桃山御陵及其他神社进行参拜）。上述措施意味着国家、自治体、国立和公立学校与神社、神道分离，这是民主革命必不可少的一项内容。
该指令还给一切宗教以平等权利，禁止将宗教用于政治目的，彻底否定日本人过去在朝鲜、中国的台湾和东北地区以及国联允其托管的南洋诸岛强行修建天照大神的神社并强制其他民族进行参拜的行为。更为重要的是，它还命令取缔天皇在门第和血统上优于外国元首的思想，以及日本人作为大和民族的优越意识，这就给予天皇和天皇制以最沉重的打击。据此推延，规定所谓不敬罪的基础也被摧毁。
第六部分落太平洋（7）
与此同时，盟军总司令部的成员还通过天皇周围的大臣们，暗示天皇应以自觉自愿的形式发布一道彻底破除天皇至高无上观念的诏书。当时的币原首相经与天皇商议后，马上就用流畅的英文说出了诏书的内容。数日后，币原将起草好的诏书送给盟军总司令部和天皇审阅，在应天皇要求加上《五条誓约》后，获得通过。1946年1月1日，具有历史意义的被称为《人的宣言》有人译作《人间宣言》、《凡人宣言》。的诏书公开发表了。其中最值得注意的是以下这段： ……朕与汝等国民间之纽带，始终以相互信赖和敬意结成，非单依神话和传说而产生，也非因以天皇为现世神、且以日本国民为优越于其他民族之民族并注定要统治世界之虚构观念而形成…… 这份天皇对神格作自我否定的诏书，好似晴天霹雳，使日本国民受到了很大的冲击，令他们感到异常新奇。盟军总司令部和国外舆论界也都纷纷予以高度评价。
麦克阿瑟破除了天皇制的迷信色彩后，又开始动摇天皇制的经济基础。他认为，庞大的皇室财产是天皇尊严的物质基础，如果将其取消，天皇的神秘性也就会随之消失。1945年10月30 日，盟军总司令部正式公布了天皇的财产总额为159亿日元。即使是如此庞大的数额，也是在评估时被极力压低过的，例如，对土地和建筑物的估价是时价的1/10，木材的估价则是 1％。皇室的财产是由日本政府和宫内省进行估价的。他们为了避免引起盟军和全世界人民的注目，有意压低了评估价格。即使这样，在一般国民眼里，天皇仍是世界上最大的富豪。
等盟军发觉估价存在着问题后，大藏省赶紧将159亿更正为37亿多日元。宫内省计划将其大部分转为国有，以免将来成为课税的对象。1946年，宫内大臣松平庆民向盟军表示，天皇希望将财产下拨给国家。新首相吉田茂也曾就此事同麦克阿瑟交谈过，但盟军总司令部不予理睬，仍然发布命令，同对一般财阀一样，对皇室财产征收超额累进税，规定1947年3月底以前交纳90％的财产税计33亿元。天皇本想把剩下的4亿日元也捐赠给国家，作赔偿费使用。
但盟军不允许他捞取这个好名声，而是将4亿日元财产的大部分收归国有了。所谓“收归国有”并非真正归国家所有，而是将其作为皇室的公用，其事务由宫内省办理。实际上，皇室的财产依然如故。不同的是，在财产发生变动时，须经皇室经济会议认可。此外还规定，此项财产不能用于收益目的，经营事业则不许赚钱也不许赔钱。
修改宪法工作是1945年10月开始的。当时的币原内阁组织了一个以国务大臣松本NB97E治为首的宪法问题调查委员会。经过三个月的拖延推诿，松本向内阁会议提交了他的宪法修改草案。
该草案基本承袭了原来的帝国宪法，仍维护天皇的统治大权，只是把“天皇神圣不可侵犯” 改为“天皇至尊不可侵犯”。在草案正式提交盟军总司令部前，《每日新闻》于1946年2月1 日抢先披露了草案的大致内容。对这种极为保守�