决企业管理的软件SAAC，帮助中小企业广告推广的商业机构阿里妈妈，在2005年对全球著名搜索引擎公司——雅虎旗下的中国分部实现了并购。
马云与其伙伴在商业上的成功不仅仅在于开辟了一个中国中小企业商务的新途径，更在于在实践上取得了相当的成功。在阿里巴巴独辟蹊径的B2B领域里淘到金，进而完成了现金流转正，不再烧钱之后，在C2C领域阿里巴巴又成功地在市场上完成了对领先的世界级公司EBay的挑战，使得该公司因为市场份额的下降不得不进行重组。
不仅如此，在创业期间，阿里巴巴公司还顺利地渡过了天灾对该公司的考验——在2003年整个中国非典流行之时，因为参加广交会，阿里巴巴的一名雇员染上非典。进而全公司人员被政府相关部门遣散回家封闭，在服从政府法令的同时，阿里巴巴全体雇员没有放弃工作，在各自的家中完成了SOHU式办公长达两个月，顺利渡过了封闭期。公司的业务在此期间不但没有垮掉，而且有相当的上升。显示其公司文化坚强的创造力。
随着商业上的一系列成功，阿里巴巴公司已经成为全球著名的互联网电子商务公司．而阿里巴巴也从一间不起眼的小公司迅速发展成为雇员达到一万两千人，营业额达到二十多亿的大型互联网公司，并实现了集团化。2007年，阿里巴巴集团对其旗下的B2B公司实现了上市。
马云和他的伙伴们在商业上的成功，是一个互联网时代的奇迹。
马云团队是一支标准的平凡人做出不平凡的事业的团队。在这支团队创业的初期没有高级的技术人才，没有高级的管理人才，只是因为马云看到了一个巨大的互联网应用于商业的商机而投入的市场。在高技术的互联网领域，阿里巴巴这样一个公司的生存和发展，完全是马云团队公司理念的胜利。
◆湖畔生涯
1999年1月15日，马云和他的团队在北京做完外经贸部的官方网站和网上中国商品交易市场项目后，悄然南下，回到他们中大多数人的家——杭州。而此时，他们离开的北京，互联网正掀起一波高潮。
不过就1999年而言，马云在杭州建立基地，使这支团队中的所有人除了这个当时还没有取名的公司之外，找不到一个更适合他们就业的地方——虽然浙江一直是创业的风水宝地，但以互联网为创业平台的公司到1998年还没有几家。这就是马云所说的逃离北京使他们逃离了很多诱惑的原因。而“离钱更近”则是指在浙江这块地方建立基地，使他们与后来的主要客户——中小型企业距离极近，为未来阿里巴巴成为中国第一个有营业收入并且赢利的公司打下了基础。众所周知，浙江是民营中小企业扎堆程度最高的一个省份。
马云决心回到杭州的时候，并没有想明白这支团队未来要做什么。
虽然在中国黄页和外经贸部的两段经历，决定了马云未来必然会做一个基于互联网的、用于商业的网站形式的公司，但以BBS的形式来实现把商人聚集起来寻找生意机会，是他们回到杭州以后才讨论出来并付诸实施的。
所以，这伙人的创业起步的故事听起来是十分悲壮的：他们聚集在一起，却不知道要做什么；没有很好的工作环境，创业地点是在马云的家——杭州刚刚开发的城西居住区的一个公寓；创业的资本是五十万元钱，这是所有员工把自己的积蓄凑起来的总和。马云说所有人都不能向别人借钱，尤其不能向父母借钱，必须做好创业失败的准备，愿赌服输。而在这样一个资金面上，创业的条件是每人五百元月薪，所有的人都围绕着马云的家租房住，步行距离不超过五分钟——为的是压缩创业成本。因为他们的五十万元钱相对于一个网站的投资而言确实不多，要开张一个网站，这五十万元钱是所有电脑、服务器、办公家具的来源，同时这笔钱还必须支付其后的工资、伙食、电话费、上网费开支。
虽然当时风险投资对互联网的投资正处于热潮上，但正如我们在后面可以看到的那样，马云把这个网站看得非常之重，不肯轻易出让自己的股份。
现在，轮到这群年轻人来画中国电子商务这块饼了。可以肯定的是，直到今天，整个阿里巴巴和它在中国为数不少的追随者所经营的道路，大局都是在1998年到1999年由这群年轻人设计决定的。正是当时他们的梦想一点点变为现实的过程中所进发出来的力量，推动着阿里巴巴一直向前走，而所有阿里巴巴的作为，到现在还没有跳出这个梦想的大局。
可以说，成就每一家伟大企业的背后，都会有梦想。梦想也许是一个，也许有几个，而且在不同时期，企业的创造者们有着不同的梦想。
可以说能够支撑企业走得更远的，一定是企业背后的那个梦想。而在阿里巴巴这个年轻，没有多少经验，自身也说不上有多少知名度的企业里，给人印象最深的是梦想推动企业前行的力量。
阿里巴巴的梦想总结起来就一句话，也就是：“天下没有难做的生意。”他们想要做到的，就是用互联网的力量减少商务成本，撮合生意成交。从所有企业减少的商务成本中，阿里巴巴分享到其中的一块，成为它营业收入和利润的来源．在这个梦想的推动下，阿里巴巴在六年中经历了创业，获得风险投资，取得营业收入，每天营业收入一百万元，每天利润一百万元到每天上缴税收一百万元六个阶段，每年都登上一个台阶，成为全球电子商务领域里的领先者。至少到目前为止，我们可以说这样一个梦想对阿里巴巴的推动力，被他们发挥到了极致。
为什么马云和他的创业伙伴们一定会做电子商务？
首先，很简单，因为他们从进入互联网开始就一直在与中国的商人们打交道。这一片区域他们熟悉并且知道有人愿意埋单，而针对普通消费者的门户网站和娱乐性网站他们不熟悉。
其次，也是最重要的一点，在1998年到1999年方兴未艾的互联网热潮中，关于电子商务还没有定义出B2B（企业对企业）、B2C（企业对个人）、C2C（个人对个人）这样三个方向，但在互联网的先行国家美国，已经有公司用自己的行动给电子商务领域定出了初步的方向。
在外经贸部工作的那段经历告诉马云，中国加入世界贸易组织只会是一个时间问题。在北京的那段日子，马云体验到政府高层对人世的根本性看法：要想使中国真正强大起来，就必须完成工业化，而要让中国工业化，其出路就在于让中国产品源源不断地供应世界，否则以中国巨大的人口基数，工业化形成的生产能力无法在内部消化。所以，人世是必经的一道门槛。对于大量中国中小型企业来说，成为世界的工业产品供应商所要跨越的门槛非常大。因此，需要的服务空间也是巨大的。用电子商务帮助他们跨越这些障碍，马云有相当的信心。当然，更重要的是让他们熟悉这个领域。
“在外经贸部做网上中国大市场的时期，和在中国黄页阶段一样，我们花了很大的精力，说服客户到这个网站上来展示他们的产品，其实这种花费并不多，一个企业才花费三百元钱。但是，看来这种花了我们很大精力的业务，远不如我们几乎没有花多少精力在这个网站上建立的一个BBS论坛来得热闹，那里经常会有一些人在上面贴自己要买什么卖什么的消息，完全不要我们花什么精力。”阿里巴巴的一位创业元老说，“所以，在回杭州开始自己创业的时候，我们自然地就从这里出发。”
到这里，未来推动阿里巴巴前进的梦想已经基本构画完成了。时间是1999年2月。
一个远在天边但后来被证实是可行的梦想，一支具有高度凝聚力的团队，一些保证执行力的原则，一笔勉强可以保证起步的钱，一个技术上可行的操作起点，马云团队开始上路了。
到1999年底，这家取名为阿里巴巴的网站的日点击率上升到了八万。
◆初识孙正义
阿里巴巴首轮所谓“天使基金”来自高盛为主的一批投行，投资额为五百万美元，而更为庞大的投资数额则来自日本的孙正义。
马云与孙正义的认识是在2000年的冬天，就在阿里巴巴获得高盛的投资之后。当时有一个叫古塔的印度人想把马云介绍给美国的一家投资公司，但与古塔见面了解了那家投资公司后，马云认为那家公司是高盛的对手，所以没有答应做进一步深入交谈，而是拒绝了这笔风险投资。
不过古塔似乎没有放弃给阿里巴巴介绍风险投资的想法，不久，他又给马云发来一封电子邮件，神秘地说：“有一个人你一定要见见，几天之后他会在北京见你。”
古塔说的这个人就是孙正义——日本软银公司董事长兼总裁，互联网产业独一无二的造梦人，一个成就了无数人互联网梦想的人。
马云一开始并没有把这件事放在心上，他之所以还是去了北京，多半是因为古塔的盛情，对于这样一个热心人确实没有多少人会有勇气拒绝。
到了北京，马云才知道他要见的人是孙正义，而且场面与他想象的也不太一样。不是很多人等着要见马云一个人，而是孙正义和几个人一起见一大批等待风险投资的中国互联网公司的头脑们。
看到这样的情景，马云自述他对这次见面没有抱多大兴趣。但他还是耐心地等到了向孙正义陈述阿里巴巴情况的时刻，这种耐心更多地来自于“既然已经从杭州到了北京，也就不差再等那一点时间”的想法。
而这种等待却得到了一个后来在阿里巴巴被称为“最经典的六分钟”的结果。
“原来我大概要讲十分钟左右，可是估计我讲到六分钟左右的时候，孙正义就从长桌子的那一头走过来对我说，他要投资我的公司。”马云说。
对于这种多少有点疯狂的场景——因为孙正义的这个决定最后导致了两千万美元流向阿里巴巴，马云的评价是“一见钟情”