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山本从飞行员的战果报告中认为已经给予美军在瓜岛海域的舰船巨大打击，便决定提前结束“Ｘ行动”而转入攻击新几内亚岛的“Ｙ行动”，因此命令所有刚结束对瓜岛攻击的飞机于８日撤回拉包尔，稍事休整后即发起“Ｙ行动”。由于所罗门群岛天气相当恶劣，很多飞机无法按计划返回，直到４月９日才陆续返回拉包尔。山本随即在拉包尔召开作战会议，决定于１０日投入４４架一式陆上攻击机和１３１架零式战斗机，发动以莫尔兹比港为主要目标的“Ｙ行动”。
１０日天公不作美，大面积的积雨云正好覆盖在新几内亚岛上空，日军飞机必经之路的欧文斯坦利山脉被阴云笼罩，飞机无法飞越，“Ｙ行动”只得延期实施。在“Ｙ行动”全面实施前，日军就寻找一些没有受到恶劣天气影响的目标进行攻击，如４月１１日，日军侦察机发现美军在新几内亚岛东部的奥鲁湾锚泊着一批船只，山本立即下令出击，２１架九九式舰载轰炸机在７２架零式战斗机掩护下前往攻击，美军起飞５０架Ｐ－３８“闪电”战斗机迎击，日军被击落６架，才击沉１艘运输船，击伤１艘扫雷艇，还有１艘运输船因伤抢滩搁浅。美机无一损失。而返航的日军飞行员却声称击沉驱逐舰１艘、运输船４艘。
４月１１日１８时，根据气象预报，明天天气将会好转，山本下令１２日晨开始实施“Ｙ行动”！参战飞机分为三部分，一是由５５架零式战斗机组成的制空队，由纳富健二郎大尉指挥；二是第一攻击队，由１７架一式陆上攻击机和３２架零式战斗机组成，由铃木正一中佐指挥；三是第二攻击机，由２７架一式陆上攻击机和４４架零式战斗机组成，由中村友男中佐指挥。
４月１２日晨，参战的１７５架日机陆续起飞，８时４５分在拉包尔上空编好队形，两个攻击队以６８００米高度，相隔１０００米向莫尔兹比港飞去，而制空队则在攻击队上方５００米高度掩护。
美军在日机到达前四十分钟发出警报，并起飞４４架战斗机迎战，双方战斗机发生激战，日军有９架战斗机和１６架攻击机被击落，但其余攻击机总算突破了美机的拦截飞临莫尔兹比港，冒着美军异常猛烈的地面炮火对机场和港口进行了轰炸，美军机场跑道有三处被炸，一座油库起火，很多营房被毁，１９架飞机在地面被毁，空战中还损失了２架战斗机，所幸船只没有损失。
４月１４日，日军侦察机发现在巴布亚半岛东南的米尔恩湾有１０艘大型运输船和７艘中型运输船——这是美军从莫尔兹比港出发向米尔恩湾运送人员和物资的护航船队，由４艘运输船和５艘护卫舰组成，１４日晨到达目的地，被日机发现时正在进行物资卸载——日军立即出动１８５架飞机前去攻击，日机刚刚起飞，就被盟军海岸监视哨发现，美军指挥部随即发出警报，正在进行卸载的运输船立即停止作业，迅速出港规避，１２时许日机到达时，美军船队已经到达开阔海面，做好了防空准备，日机发现目标当即开始俯冲攻击，在空中掩护的美机和护航军舰的高炮密切协同，击落７架日机，美军损失飞机３架，被炸沉炸伤运输船各１艘。日军飞行员战果报告却是击沉运输船４艘，击伤６艘，击落美机４４架。
由于４月１６日日军侦察机在布纳附近海域没有发现船只，加上天气预报该海域即将受恶劣天气影响，山本担心出击的飞机返航时会遭遇恶劣天气，便取消了原定１６日空袭布纳的计划。
山本认为经过这些天的大规模空袭，从飞行员的战果报告来看，已经给予美军沉重打击，达到了预期目的，便宣布“伊号作战”胜利结束，第三舰队所属的舰载机全部返回特鲁克。
在历时十天的“伊号作战”中，日军共击沉盟国运输船２艘，驱逐舰、护卫舰和油船各１艘，击落击毁飞机３１架。日军损失飞机５９架，其中九九式舰载轰炸机１６架，还有１７架九九式被击伤。损失的九九式占全部参战九九式的３０％，如果算上击伤的，损伤总数占全部的６０％。这样的消耗是日军难以承受的，因此第三舰队返回特鲁克后，由于飞机和飞行员得不到补充，第一航空战队只好将部分飞机、器材和飞行员移交给第二航空战队，然后于５月３日离开特鲁克返回本土补充，这样日军在南太平洋的航母数量又减少了２艘，进一步削弱了日军在南太平洋前线的航母实力。从这点上来讲，“伊号作战”绝对是得不偿失的，给美军所造成的损失并不显著，但自己损耗却不小，尤其是２艘航母返回本土，直接影响了以后的作战。其实这一点，日军第三舰队内部早在制定“伊号作战”计划时，就有人预见到航母舰载航空兵损失难以补充而提出反对意见，但山本急于尽早消灭美军航空力量，保障己方加强防御准备，顾不得许多了。这也是山本一贯“要么大赢，要么大输”作战思想的典型表现。
就在日军进行“伊号作战”期间的４月１５日，美军南太平洋两位重量级的将领首次碰面，南太平洋部队司令哈尔西海军中将前往布里斯班的西南太平洋战区司令部，与西南太平洋战区总司令麦克阿瑟陆军上将进行了会晤。在两人见面之前，无论华盛顿的美国高层领导还是两人的参谋人员，对此次会晤都深感担忧，担心这两位极具个性的将军会发生冲突，从而影响即将开始的联合作战。然而出人意料的是，这两人竟然一见如故，英雄惜英雄，彼此相互敬重，三天的会议虽然有过争论，但总体相当圆满，两人及其各自的参谋人员一起制订了１９４３年下半年南太平洋的反攻计划，即“埃尔克顿”计划，后改称“硬币”作战，这一计划规定南太平洋美军在１９４３年１２月前，以所罗门群岛和新几内亚岛为目标，至少实施十三次登陆，最终形成对拉包尔的夹击之势。在上述作战中，南太平洋部队和西南太平洋战区的部队必须为对方的作战提供必要支援。５月中旬首先由麦克阿瑟部队发起攻击，夺取伍德拉克岛和基里维那岛；接着哈尔西的部队应占领新乔治亚岛；７月后麦克阿瑟将继续发展进攻，攻克莱城和萨拉莫拉，并占领马丹和胡翁半岛；与此同时，哈尔西的部队也应夺取肖特兰岛和布干维尔岛南部的布因；最后麦克阿瑟将从胡翁半岛推进到新不列颠岛，哈尔西则应全部占领布干维尔岛，实现参谋长联席会议３月２９日对拉包尔的反攻指示精神。
四、山本之死
１９４３年４月１４日，珍珠港，早上８时刚过，美国太平洋舰队司令部的情报参谋埃德温&；#183；莱顿海军中校拿着一份文件快步走进美国太平洋战区总司令兼太平洋舰队司令切斯特&；#183；尼米兹海军上将的办公室，莱顿手上的文件是太平洋舰队无线电情报分队凌晨刚刚截获并破译的日军机密电报，无线电情报分队是在原来由罗彻斯特海军中校指挥的夏威夷海军情报中心站的基础上组建的，该情报站就是破译了日军中途岛战役作战计划密码的功臣单位，现在已经拥有一千多工作人员，由威廉&；#183；戈金斯海军上校负责，专门负责截收日本海军的无线电通讯，然后进行破译、翻译及情报分析，此时分队的密码专家已经逐步掌握了日军各作战单位的战时无线电呼号，摸索出了日军密码变化规律，并成功破译出了日军的部分密码，其中有日本海军运输调度所使用的密码，从中洞悉日军运输船队的航线及中途停泊港，这些准确的情报为美军潜艇部队的破交作战提供了最大的便利。现在破译出的这份绝密电报内容如下：
“联合舰队司令长官定于４月１８日视察巴拉尔、肖特兰和布因的日程安排如下：
８时，乘座一式陆上攻击机由６架战斗机护航，从拉包尔起飞；
１０时，到达巴拉尔，换乘猎潜艇前往肖特兰；
１１时３０分，到达肖特兰；
１２时３０分，乘座猎潜艇离开肖特兰返回巴拉尔；
１３时３０分，到达巴拉尔；
１４时，乘座一式陆上攻击机离开巴拉尔；
１４时３０分，抵达布因，在第一基地司令部午餐；
１６时，从布因起飞返回拉包尔；
１７时４０分，回到拉包尔；
如遇天气不佳，本视察日程向后顺延一天。”
这是老对手日本海军联合舰队司令山本的视察日程安排，４月１３日２０时由日军东南舰队司令和第八舰队司令联名发给巴拉尔、肖特兰和布因的基地、航空队和守备队主官的。
原来山本在“伊号作战”结束后，决定利用一天时间视察巴拉尔、肖特兰和布因等前线基地，以激励士气。山本的这一决定遭到了很多人的反对，日本陆军第八方面军司令今村均陆军大将就以２月间自己前往布因视察途中座机遭遇美军战斗机的经历力劝山本取消此行，驻肖特兰岛的第八航空战队司令城岛高次海军少将甚至专程来拉包尔劝阻山本，但山本不为所动，执意要去。因此他的副官渡边海军中佐草拟了视察日程安排后要求第八方面军派专人送交，但通讯军官表示该密码４月１日刚刚启用，又是极难破译的五位乱码，美国人根本不可能破译，绝对安全，因此最后还是用无线电发出了。而美军破译专家却只用数小时就将其破译，这一电报无形之中也就成为山本的催命符！美军破译工作如此出色主要归功�