摩诃末在巴尔克一听到成吉思汗追兵来了，马上和儿子札兰丁商议下一个逃亡目标，札兰丁说：“河中局面已无能为力，现在要竭力保住呼罗珊地区和伊剌克。我们活着召回分驻各城的军队，以阿姆河为城壕，与蒙古军决战；或者退到忻都。”
伊剌克的长官们都请摩诃末到伊剌克集兵，卷土重来。摩诃末也有此打算，札兰丁持反对意见，他说：“最好的办法就是在呼罗珊地区把军队召集起来，去和蒙古人一决生死，而且我觉得这是可以办到的。如果父亲不赞成，要去伊剌克，那请把军队交给我，让我来夺取胜利。我们不应该成为众矢之的受人谴责，不应该让百姓戳着我们的脊梁骨说，我们以前只管向他们索取赋税，如今大难临头，却把他们抛弃了。”
摩诃末大吃一惊，想不到儿子居然有如此高尚的情怀，可他知道，这种高尚情怀与抵抗能力无关，他命令全军继续西撤。
路上，摩诃末的康里兵团对主子的窝囊印象深刻，于是决心废掉这位国王，只有这样，才能重返战场。摩诃末事先得到消息，偷偷从帐篷里跑了出来，睡到另外的帐篷中，第二天一早，他的帐篷被射成了筛子。可当他重新出现在众人面前时，康里兵团惊骇万分，以为摩诃末有真主保佑，自此收了反叛之心，虔诚地和摩诃末逃亡。
摩诃末用这招暂时收服了康里兵团的桀骜之心，匆忙逃到四面环山的你沙不儿城（今伊朗内沙布尔）。
哲别和速不台兵团果然按照成吉思汗的旨意紧追不舍，摩诃末在你沙不儿城惶恐地过了半月后，哲别和速不台在马尾拴上葫芦瓢，漂浮过阿姆河。消息传到你沙不儿，摩诃末大叫一声，跳起来就跑。不过在逃跑之前，他做了两件事。第一件事是送信给老母秃儿罕，他以儿子忧母的心情说，玉龙杰赤必不能守，还请母亲大人带着亲戚离开玉龙杰赤，到其他地区躲避。秃儿罕终于第一次同意了儿子的建议，举家离开玉龙杰赤。
第二件事是，摩诃末下令乡间以及不设防城镇的百姓全部迁入有防御的大城；同时命令各城指挥官，坚守本城，等他从伊剌克搬来救兵，恢复失去的国土。然而，花剌子模帝国的人没有把他的命令当回事，乡村和未设防城市的居民安土重迁，不愿离乡背井，所以蒙古军所到之处，仍然有数不清的物资供应。各地守军毫无抵抗意志，一见蒙古兵团的军旗，马上开蒙投降。
摩诃末跑出你沙不儿城，逃到可疾云。如你所知，摩诃末最终还是采取了最后一个方案。在这里，他的一名下属集结了三万人马正等着他的光临。他和将军们商讨紧急方略，已经到这个地步，所有的将军们认为应该先躲起来，摩诃末对这个主意很感兴趣，因为逃跑实在费心费力。有人提议躲到山里去，打他十年游击战，蒙古人异国他乡，必然撤走。摩诃末就跑到那座山巡视一番，回来后很沮丧地说：“这个山没有躲藏之所，蒙古人一旦放火，咱们就完蛋了。”还有人建议躲到一座易于防守的山中去，那里还很富有。摩诃末也不同意，他说：“那里的民风彪悍，我们的军队纪律也不咋样，肯定会造成敌对关系。到时，蒙古人还没有来，我们就内讧了。”
摩诃末的主意是，坚守可疾云，派人到附近地区召集军队。他说他要反攻，他的将军们鄙夷地一笑，如果摩诃末真有这样的信心，何至于跑了这么远！
事实的确如此，当哲别和速不台兵团抵达你沙不儿时，摩诃末站也不是，坐也不是，向所有人询问下一步的逃跑地点。
哲别和速不台兵团以每天一百公里的速度向前推进，呼罗珊境内大多数城池都未抵抗，开门投降。蒙古兵团也未屠城，只征发少量粮食，并委派人员管理和监督投降之城。因为二人都很明确任务是什么，那就是追击摩诃末，无论黑夜还是白昼，都只短暂地休息一会儿之后，又匆忙上马，寻着摩诃末的行踪紧急追赶。不过对于那些非常不敬的城市，两人还是拿起了屠刀。
比如在咱维城下，哲别要城民供应粮草，但城民紧闭城门，把蒙古人当空气。哲别因为追赶摩诃末，懒得理这座城，于是放它一命。可就当哲别绕城而走时，咱维城守军居然望着远去的蒙古军，在城头架起锣鼓，敲打着叫骂着。当然，他们肯定请了些懂蒙古语的人叫骂，所以蒙古人听明白了，突然回师发起猛攻，三天之后，咱维城被攻陷，城内凡是活物统统杀光。这是蒙古军在呼罗珊地区进行的第一次大屠杀，引起了巨大震撼。
1220年六月，哲别和速不台来到你沙不儿城下，你沙不儿城像是迎接天神一样把蒙古人迎进城，给钱给粮给马，同时还给了摩诃末逃跑的路线，并且替蒙古人分析摩诃末最可能逃到的地方，于是，哲别和速不台兵分二路，分头扫荡花剌子模势力。两支军队在剌夷城（今伊朗德黑兰南）会师，剌夷城拒不投降，哲别和速不台发起为期五天的猛烈攻击，剌夷城只能陷落。剌夷城是可疾云的门户，它一失，可疾云就失去了作为基地的意义。消息传到可疾云时，摩诃末大叫一声，还未来得及逃跑，他手下的军队先行一步，一哄而散。
摩诃末想不到逃跑现在成了花剌子模帝国的主旋律，而且每个人的成绩都属上乘。他只好带着札兰丁和少数还能跟从他的士兵出可疾云，逃往一个叫哈伦堡的军事据点。哲别和速不台兵团紧紧追赶，就在可疾云城和哈伦堡中途，蒙古人追上了这位如丧家之犬的国王，双方展开激烈的野战。康里兵团的战斗力真不是浪得虚名，以一敌十，紧紧拖住了蒙古人。在乱战中，蒙古骑兵向正准备逃跑的摩诃末射出乱箭，摩诃末的马负伤，但这并不影响摩诃末逃跑的速度，他挥舞起鞭子，猛抽坐骑，一溜烟从战场消失了。
哲别和速不台兵团如怨鬼，如毒蛇，执着地纠缠着他。所以他在哈伦堡只停留一日，就翻身上马，继续逃。不过此时，他长了个心眼。他让人散布消息说，他要逃去报达城，向哈里发谢罪，要哈里发在伊斯兰世界发动圣战。可在半路，他折入卡兹文山区。哲别和速不台向报达城方向追了两天，不见摩诃末的一点影踪，知道受骗，所以返回，进入卡兹文山区。
摩诃末发现蒙古人的鼻子比狗还灵，慌忙逃出卡兹文山区，乘船逃入里海，蒙古前锋追到海边，只好望洋兴叹。摩诃末找到了一个岛，他住了下来。置身于这无边无际的大海中间，他辛酸地回忆过去，平静地估量现在，并且可以从容地设想未来。由于跟随的人已太少，他只能自力更生，每日三餐需要亲自动手。
从一个大帝国的皇帝沦落到如此境地，摩诃末居然很欣慰，因为蒙古人追不到这里来。当然，他的心境是晦暗的，又生了病，所以他经常看着陆地方向悲叹：“我征服了那么多国家，拓展了那么多土地，想不到现在连块做坟墓的土地都没有！”
他的土地正在被哲别和速不台残忍地蚕食。哲别和速不台追不到他，就把气撒到摩诃末母亲秃儿罕躲避的城堡，在围困两个堡垒四个月后，秃儿罕带领王族和守军投降，成吉思汗下令把秃儿罕带回蒙古，这位始终把儿子当外人的老太婆于1233年悲惨地死在蒙古。
秃儿罕肯定和成吉思汗探讨过一个问题——成吉思汗曾答应她要把呼罗珊地区给她，这位愚蠢透顶的老女人一定也获得了成吉思汗的嘲讽，说她胳膊肘向外拐。她的命运是她自己得来的，和别人无关。
摩诃末得到老母和王族全部覆没的消息后，病症更加严重，精力每况愈下，他知道自己命不久矣，就把札兰丁叫到身边，对着几个随从说：“现在只有札兰丁具有挽救国家危亡的能力，他不怕敌人，相反，他还要去找敌人厮杀。现在我发誓，一旦札兰丁取得抗蒙战争的胜利，真主重新给我旧日的威权，我必定在国内施行公道和仁政。”
他取下象征着权力的佩剑，挂在札兰丁的腰带上，说：“现在，花剌子模国国王就是你了，完成你的使命去吧！”
札兰丁看着有气无力、精神萎靡的老爹，流下眼泪说：“我们国土现在遭受蒙古人的侵占，我军溃散，如秋风吹落叶。当这危难之时，我接受父王的命令接管花剌子模帝国，统领虚无的军队。虽然这样，我要在成吉思汗的黑暗笼罩的夜里，发出最大的光明，召集国家的勇士，同赴国难！”
摩诃末也流下泪水，软弱地挥挥手说：“走吧，去战场，让蒙古人见识下真正的花剌子模男人的勇气！”
札兰丁和老爹摩诃末依依不舍，乘一艘小船离开了荒凉的岛屿，父子二人的这次离开很快就成了诀别。
1221年腊月十六，摩诃末在病痛和精神的折磨下死在那个荒凉的岛屿上。他的尸体被岛屿上仅有的三个人草草埋葬，一代人物，成为绝响。据说，摩诃末临死前，撒马尔罕冬雷阵阵，惊天动地。成吉思汗急问耶律楚材这是何兆。耶律楚材卜算后说：“此乃吉兆，摩诃末快死了。”
札兰丁听到老爹去世的消息时，正在玉龙杰赤招兵买马，准备和蒙古人一决生死。他当着守军的面放声大哭，哭得肝肠寸断。这种情绪在军队中引起剧烈的回响，整个玉龙杰赤，甚至是整个花剌子模都被老国王的抑郁而死和新国王的哭声感动，他们发誓要和蒙古人作战到底。
成吉思汗将面对新的敌人，这个敌人的武器是悲愤和反攻复国的决心。
呼罗珊大屠杀
自攻陷撒马尔罕后，成吉思汗就开始在撒马尔罕郊区避暑。这年秋天，成吉思汗和幼子拖雷对忒耳迷城（今乌兹别克斯坦泰尔梅兹）发动进攻。进攻之前，成吉思汗派人进城劝降。忒耳迷城守军把劝降者的脑袋射满箭矢，扔给成吉思汗。他们告诉成吉思汗：“老子的城市有一半耸立在阿姆河中，易守难攻，而且城里有如沙子