系列改革措施让人眼花缭乱，其目的无非想使大清统治千秋万代，结果却引起守旧派和派的强烈不满，对各项措施都予以抨击和阻止。
守旧派多是朝中官员，他们认为君主立宪会架空皇帝，进而丧失皇权；新设立的总理大臣大权在握，把持朝政，一旦紊乱朝纲，便会行王莽、曹操之举，进行改朝换代。所以拼命加以阻止，便有了朝廷官员之间相互攻讦的“丁未政潮”。
派为了自己能够夺权，对于所有可能巩固朝廷统治的措施都持反对意见，也不管这些措施是否与民有利。由于派无权无势，只好采用最暴力的手段来表达自己的意志：造反。江南一带迅速成为火药桶：1906年12月，湖南爆发萍浏醴起义；1907年6月，广东发生七女湖起义；7月，安徽爆发安庆起义；9月，广东发生钦廉防城起义……
正是这两股势力捣乱，让清末原本就岌岌可危的政局变成了摇摇欲坠。这好比大海上一条顶风逆行的破船，几个有眼光的船员发现风向不对、船体破裂，便劝船长一边调转船头、一边维修破船。刚提出自己的看法，马上有人站出来反对：“不行船是祖宗留下的，不能乱动；方向是祖宗指定的，不能乱改。”在两派吐沫横飞、各持己见的时候，却有些人拿出锤子斧头，对着破船就是一通破坏，用行动表示自己的看法：我们应该打倒一切，废旧立新就这样，本来还能多支撑几年的破船，在三伙人的角力下，在原地打转转，并出现下沉的迹象。
朝中乱局在湖北也有体现：
主流是立宪派，以湖广总督张之洞为代表，声势最大。虽然主张君主立宪，其实心中还是倾向于确保皇权，所以他们和守旧的保皇派之间没有太大的冲突，反倒有合流的意思。
铁杆保皇派除了乡间士绅老儒，在官场上也有，不过影响力有限，毕竟张南皮在湖北呆了这么多年，不合自己意思的官员早被他扫地出门了。
至于派，主要是广大新式学堂学生、以及编练的新军，属于潜流，在正式场合完全没有任何声音。但在暗地里，却蠢蠢欲动。
作为生在风里、长在红旗下的新青年，孙元起在心底里是倾向于的。但来清朝这么多年，思想也发生一些变化，对于有了自己的看法：暴力必须在杰出人物的领导下，发生在可控范围内，不能损害国家和大多数国民的利益；发生之后，国家应该迅速稳定下来，转向经济建设，改善民生，而不是社会动荡、军阀魂战。
年初偶尔一个机会，孙元起看到去年秋冬间孙中山、黄兴等人在东京制定的《方略》，其中《对外宣言》有这么几条：在成功之后，“所有中国前此与各国缔结之条约，皆继续有效”、“偿款外债照旧担任，仍由各省洋关如数摊还”、“所有外人之既得权利，一体保护”。尽管孙元起明白，这是党人为了获取列强支持而不得不采取的办法，心中依然愤愤不平，对同盟会颇为失望。
即便对同盟会失望，孙元起对于它的未来还是有所期待，希望它能肩负起历史的重任，推翻满清，建立民国；而不是企盼满清政府立宪成功，华夏子孙永远做满人皇帝的奴才。
对立宪不免持有消极的观望态度，加上自己对于学校进行大胆改制，消减其中经学内容，在湖北官场上孙元起便成了另类。张之洞出任协办大学士之后，直接绕开孙元起这个湖北提学使，在武昌成立一所存古学堂，训词中说道：“近日学堂怪风恶俗，不忍睹闻。为国家计，则必有乱臣贼子之祸；为世道计，尤不胜洪水猛兽之忧。谨于湖北省设立存古学堂，以经、史、词章、博览四门为主，而以普通科学辅之，庶经训不坠，以保国粹而息乱。”
这几乎是指着孙元起的鼻子，否定他在过去一年间的所作所为了。很多人以为孙元起会在短时间内灰溜溜地滚出湖北，谁成知很快离开湖北的却是张之洞。但人家是荣升大学士、军机大臣，在湖北他的影响力还在，足以让孙元起的一些改革措施遭受或明或暗的阻碍，甚至有些举步维艰。
政局波谲云诡，让人难以捉摸。据学生们反应，激进的党人甚至把自己改造学堂、提高教育质量的行为，视为维护清廷统治，大为不满。如果他们有机会，想来不会介意在自己的刺杀成果上增加一个提学使吧？按照张之洞等保守派的态度，如果杀一儆百维护朝廷稳固，想来清政府也不会吝啬革职拿办一个提学使吧？
孙元起本来就不耐烦做官，被张之洞批判之后，便萌生去意。谁知告病辞呈还没写好，张之洞先向朝廷请假养病。之后，便是张之洞北上、赵尔巽西来。乘着新旧交替的间隙，孙元起准备先把全省中小学布局做个大调整，顺便把自强学堂改建为武昌大学堂，等事情告竣后再辞职，也算善始善终吧。
就在这个时候，他接到了瑞典皇家科学院的电报。
诺贝尔化学奖？从这个奖项来能看出…：卢瑟福的推荐没有白费；正统的科学家对于光电效应、量子力学、相对论等，还是持半信半疑的态度；作为物理系研究生，孙元起的中学化学没有白学。
按照惯例，诺贝尔奖是在每年的12月10日颁发，今年也不例外。既然有这个光明正大的理由，孙元起决定把自己的离职日期提前到11月中旬。想定以后，孙元起给瑞典皇家科学院回了一封电报，除表示感谢之外，还表示自己现在是官员，不便请假参加颁奖仪式，如果贵国能够通过外交途径向清政府提出邀请，或许自己可以前往。另外，又给耶鲁、MIT发去电报，表示自己在明年年初有空，希望他们能利用美国政府向大清外务部提出访问要求。
自从1904年秋天孙元起离开之后，已经三年多没有踏上美洲大陆。耶鲁和MIT一再邀请，都因为各种原因而耽搁下来，以至于今。尽管耶鲁、MIT派不少留学生和研究人员到中国，与孙元起讨论相关研究计划，但中美遥隔万里，实验设备也不齐全，讨论的时候总有一种到喉不到胃的感觉。
孙元起非常自信，瑞典和美国一定会邀请自己。发出电报之后，便向朝廷递送了出国游学恳请开缺的折子。接着，迅速集中精力，投入到湖北教育改造大业中去。对于自强学堂的改造比较简单，只要对照经世大学的学科设置便可以，加上经世大学新一届毕业学生的到来，操作空间非常大。关键是中小学布局。
清末，湖北共两千四百万人，按照人口比例，应该就读中小学的人数至少在四百万人以上。即便每所学校有400名学生，全省也应该有一万所中小学。事实上，眼下湖北平均每所学堂只有数十人，总共在校学生只有五六万人足见形势艰巨。
张之洞非常重视教育，在他支持下，如今湖北每年教育经费达到两百万两白银，在全国都是首屈一指的。然而这些银子对于人数超过四百万的庞大基础教育工程来说，无疑是杯水车薪，何况这些银子里还包括各种师范学堂、实业学堂呢？
孙元起不是救世主，不可能一下子变出如许真金白银，来建设数以万计的中小学。他能做的，就是搭好框架，把每一分钱用到实处，正好比螺蛳壳内做道场。
和杨度、章士钊、刘师培等幕僚商量之后，决定按照每个县的人口来确定公立学校的数额：每十万人，设立两所小学、一所中学；不足十万人，仍为两所小学、一所中学；超过五十万人，则不再增设学校。鼓励地方乡绅自主办校，教学规模超过公立中学者由各府县予以褒奖。此外，孙元起还请蔡元培在湖北设立了两所经世大学附属学校，力所能及地减轻政府的压力。
公立学校参照经世大学附属学校的规矩，分两种班，采用同样的师资教学，一种面向家境比较宽裕的，收取学费；一种面向普通家庭的，不收取费用。免费班级每年要淘汰末尾的20学生，转入收费的班级；收费班级中成绩优异的20学生，也可以申请进入免费的班级。这样既可以取富济贫，减轻学校的经费压力，也可以促进学生良性竞争，好好学习，选拔天资聪颖的学生。
没有办法，实在是财力有限，只好采用斯巴达式的学习训练，选取精英优先教育。
十月中旬拿出方案后，孙元起把提学使司的所有人员都派到各府县，监督公立学校的成立与改造。他自己也不例外，来到武昌府南一百八十里的通山，亲自参加搭建通山公立第一中学、第二中学的工作。
果然不出所料，瑞典和美国相继向清政府的外务部发来照会，希望邀请孙元起出国访问；再加上孙元起自己上奏的恳请开缺的折子，朝廷很快给孙元起发来诏命：着学部右侍郎衔、署湖北提学使孙元起充任头等钦差大臣，出使瑞典、美利坚等国考察学务，赏假三个月，毋庸开缺。
第一五二章渔竿今作水边人
一五二、渔竿今作水边人
因为孙元起在通山参与公立中小学的搭建，诏书也被送到通山。接旨之后，孙元起屈指一算，眼下已经十一月上旬，从上海坐船到法国马赛，至少要二十天，从马赛到斯德哥尔摩还需要些日子，时间颇为紧张，最好马上动身。
通山虽然名字中有个“通”字，其实处于万山围绕之中，道路崎岖、民风闭塞，一点儿也不“通”。孙元起来此穷乡僻壤，意在用行动表明态度：一定要把把基础教育办好正因为通山不通，平日少有上官到访，便是武昌知府也是难得来一回的。孙元起作为从二品的大官来此督导教育，通山上下，从县令到贫民，无不殚精竭力用心奉承。原以为筹办学校需要大费周章，耗费些时日，结果令出如山，执行如电，十多日工夫挑选的老师和学生便全部到位，书声在城隍庙改建的学校中琅琅响起。
孙元起见此，知道学校已经走上正轨，以后的工作便是坚持，心中再无牵挂。接到圣旨后，便命随行的保安收拾好行李，自己到县衙告别。
知县听闻孙元起准备立马启程，先是一愣，转而殷切�