在敌营阵地外的山上负责监视的以色列守望兵看见非利士营中人影晃动，听到哭喊之声此起彼落，立即跑回去报告扫罗。扫罗事先并不知道儿子冒险深入虎穴，他对传令兵说：“你们清点一下人数，看看从我们这里出去的是谁？”
不一会儿，传令兵回来报告说：“只有约拿单和他的卫兵不在营地。”扫罗这才知道是约拿单他们在偷袭敌人，他立即带着剩下的士兵来到战场增援，加入了战斗。非利士人因为天黑看不清面貌，就用刀自相拼杀起来。非利士军队中的“伪军”以色列人听说本民族的军队杀进来了，也纷纷倒戈，帮助扫罗和约拿单砍杀非利士人。从前躲在丛林和山洞里的以色列人也一齐出动，前来助战。非利士人终于支持不住，大败而逃。以色列人追杀非利士人直到伯亚文。
以色列人在追击过程中又饥义渴，疲惫已极，但扫罗决定乘天色未晚，继续前进。扫罗口忏下的士兵起誓：讥不等到晚上向敌人报完了仇进食的，必受咒诅。“因此以色列人经过树林，即使见树上的蜂窝中流下蜜来也没有人敢用手指蘸一滴吸人口中。但是约拿单因为没有听说他父亲叫百姓起誓的事，所以伸出手中的枪杆，用枪头扎入蜂窝中，蜂蜜就成一条线往下流，他就用手接住，伸舌头舔食。由于饥渴感得到缓解，他的眼睛更加明亮有神。
他手下的一个士兵见他舔食蜂蜜就对他说：“你父亲曾叫百姓庄严地起誓，天黑之前不准进食，否则必受诅咒。”
约拿单不以为然他说：“那是我父亲连累了你们。你看，我尝了这一点蜜，眼睛就明亮了。今天百姓若任意吃从仇敌手中缴获的东西，击杀的非利士人不是会更多吗，”就这样一整天，以色列人追击非利士人没有停一下脚步。夜幕降临了，饥渴交加百姓急不可待地将所夺的牛羊和牛犊，宰于地上，狼吞虎咽地吃起生肉、喝起鲜血来。这样做是触，已教规的，有人告诉扫罗：“百姓吃带血的肉，做了得罪耶和华的事。”
扫罗马上禁止道：“不可这样做，这样做是犯罪的。”他对来报告的人接着说，“你们到百姓中去对他们说，你们必须在石头上宰杀生畜，让牛血羊血流进地里。不可吃带血的肉，得罪耶和华。”
扫罗还命令部下筑了一座坛，把牛羊牵了放在上面，作为献给耶和华的燔祭。这是扫罗首次为耶和华筑坛。扫罗对部下说：“我们要连夜去追赶非利士人，直到把他们杀光，不留一人。”
部下对他说：“你觉得怎么好，我们就怎么做。”
有一个随军祭司比较谨慎，他说：“我们应当向神请教。”
扫罗来到祭坛边，问上帝：“我们可不可以连夜追赶非利士人？”
耶和华默不做声。扫罗叫来百姓中的长老，交待他们：“耶和华发怒了，一定是有人今天犯了罪。要把他查出来处死。”
通过抽签，查出是国王的儿子约拿单犯了罪，约拿单只得交待了实情。扫罗痛心地对他说：“约拿单哪，你定要死；若不然，愿上帝重重地降罪于我。”
百姓听说要杀死立了首功的约拿单，一齐过来为他求情道：“陛下，约拿单在以色列人中这样大行拯救，难道也要判他的死罪吗？不，绝对不能！连一根头发也不能割他的。因为上帝今天在与他一同做事。”于是扫罗才免了约拿单的死罪。
扫罗只好放弃继续追击非利士人；非利士人回到了自己的故土，仍然威胁着以色列。（撒上13：16一14：46）撒母耳与扫罗决裂
扫乡虽然把压迫以色列入的非利士人赶出了国门，但他没有就此罢休。他明白与非利士人的最后决战的关头还未到来，即使非利士人被以色列人彻底打败了，在迦南，以色列入仍处于异教民族汪洋大海中。为了进一步的斗争，扫罗招兵买马，网罗有识之士，他任命了具有统兵才能的堂弟押尼珥为元帅。这为最后荡平迦南打下了基础。他经常出击，攻击以色列国境周围的仇敌。他先后打败了摩押人、亚们人、以东人和琐巴诸王。
但是当时除非利士人外，以色列面临的最大威胁是住在西奈山和迦南之间广阔土地上的亚玛力人。要说起来，亚玛力人还是以色列的远亲，他们是雅各的哥哥以扫的后代。但是现在经常成群结队地到迦南南部地区烧杀抢掠，强烈地冲击着以色列民族。几年来，扫罗因为忙于对付其他邻近的民族，没有顾得上攻击亚玛力人。这使大祭司撒母耳很不满。撒母耳教训扫罗说：“耶和华差遣我膏你为王，治理他的百姓。你应该听从他的话：'以色列人出埃及的路上，亚玛力人怎样待他们，怎样抵挡他们，我都没忘。现在你要去击打亚玛力人，灭尽他们所有的，不可怜惜他们。不分男女老少幼，不分牛、羊、骆驼或驴，都要尽行杀死。'”扫罗遵旨，招集百姓会师在提拉因，数兵点将，步兵多达20万，还不算犹大人的：万士兵在内。扫罗带着这个庞大的兵团，在亚玛力人京城外的河谷地带设下埋伏，大败亚玛力人。他们接着追杀亚玛力人，从哈胖拉直到埃及前的书珥，生擒了亚玛力王亚甲。但是扫罗犯了不可饶恕的罪过，因为他不肯照撒母耳的命令灭绝一切牛羊牲畜，私自保留了其中肥美的部分，只把丑陋瘦弱的杀死；更有甚者，扫罗因为佩服亚甲王的坚强不屈，竟然大发恻隐之心，赐以活命；有人还对撒母耳吹耳边风：扫罗在迦密为自己立了歌功颂德的纪念碑，现在下到吉甲去了。
撒母耳闻风而动，来到吉甲。扫罗毕恭毕敬地迎他到营地之外，对他说：“愿耶和华赐福与你，他的命令我已经执行了。”
撒母耳撩着雪白的胡须，看着身旁这位低头弯腰的大个子国王，问：“我听见有羊叫、牛鸣的声音，是从哪里来的呢？”
扫罗有些不好意思地一笑，说：“这些是从亚玛力人那里带来的，因为百姓看到上好的牛羊白白地杀了觉得可惜，就留了下来，要献与您的神耶和华。其余的我们都灭尽了。”
撒母耳有些生气了，他提高嗓门说：“你住口吧！等我把耶和华昨夜向我所说的话告诉你。”
扫罗说：“请讲。”
“耶和华说，他后悔膏你为以色列的王，因为你现在不遵守他的命令。”撒母耳简要而明白他说。
扫罗一听这话急了，他不想就这样失去王位，竭力辩解说：“我实在听从了耶和华的命令，完成了耶和华派给我的任务。我灭了亚玛力人，擒了他们的王来，把最好的牲畜拉回来献给耶和华您的神。”
可是辩解已经失去意义了，撒母耳代表上帝说话，他的心已经离扫罗而去。他反驳扫罗说：“耶和华喜欢燔祭和平安祭，难道不是更加喜欢人听他的话吗？听命胜于献祭，顺从胜于公羊的脂油。悻逆的罪，与行邪术的罪相等；顽梗的罪，与拜虚神和偶像的罪相同。你既厌弃那和华的命令，耶和华也厌弃你作王。”
扫罗见硬顶没用，态度马上软了，他说：“我知道我有罪。现在求您同我一同回营去，我好敬拜耶和华。”
“今天那和华使以色列国与你断绝关系，将这国赐与比你更好的人。”撒母耳并不愿意给扫罗这个面子：跟他进营地，就等于承认他作王的地位。撒母耳说完，转身要走，扫罗就扯住他外袍的衣襟，不肯撤手，直到把衣襟扯坏。
大祭司过大营而不入将使扫罗的国王地位失去神圣的光环。
扫罗不顾尊严。再一次苦苦哀求：“我承认，我有罪。尽管如此，在还没有新国王代替我发挥作用之前，求你看在那和华的面子上，跟我进去一趟，在全会众面前抬举我。”
撒母耳想，现在还不是给扫罗的颜色看的最后时刻，于是他改变了主意，转身跟随扫罗回去，扫罗就作大祭司的助手，敬拜上帝。
行完敬拜礼，撒母耳说：“把亚玛力王亚甲带来。”
亚甲一听以色列的大祭司召见，以为会有什么赦令发布，就欢欢喜喜地出来。
撒母耳委婉地宣布了对亚甲的死刑判决：“你既用刀使妇人丧子，同样，你母亲在妇人中，也必丧子。”撒母耳说着在吉甲耶和华的神坛面前，将亚甲杀死。
当时在吉甲的将士并不知道国王与大祭司之间的冲突。
不久，撒母耳回到拉玛琐非，至死未同扫罗见面。但他放出风声说，他不该立扫罗为王；耶和华后悔立扫罗为王。
撒母耳开始隐秘地物色新的国王人选。（撒上14：47一15：35）
大卫受膏
撒母耳要立新王，舆论先行，但也慑于扫罗的军权，不敢冒然行事。他四处查访，十分小心谨慎地，不敢让扫罗知道。一天，上帝对撒母耳说：“你将膏油盛满了，我将差你到伯利恒人那西那里去，因为我在他的众子之内预定了一个作王的。”
“可是，我怎能去呢？扫罗如果听见风声，必来击杀我。”撒母耳心有顾虑。
耶和华给他出了个主意：“你可以带一只牛犊去，就说：'我来是要向那和华献祭。'你要请那西来吃祭肉，我就指示你所当行的事。我所指示给你的人，你要膏他。”
撒母耳遵照耶和华的指示，来到伯利恒。伯利恒的长老对撒母耳同扫罗决裂一事有所风闻，但因害怕扫罗动怒，所以对撒母耳的接待并不热情，他们战战兢兢地询问其来意，“你是为平安来的吗？”
撒母耳说：“是为平安来的，我是来给耶和华献祭的。你们当自洁，来与我同吃祭肉。”
来吃祭肉的有那西和他的儿子们。那西家属犹大支派，有8个儿子。撒母耳首先看到的是高大英俊的以利押，撤母耳一下子就喜欢上这个孩子，但是耶和华不同意：“不要看他的外貌和他身材高大，我不拣选他；因为那和华不象人看人。人是看外表，耶和华是看内心。”
那西又让他看了6个孩子，一共看了7个孩子都不满意。撒母耳就问那西：�