尾随他，窥探他，污蔑他。这所有的一切都在迫使着耶稣回到旷野中去，在祷告中寻求天父的旨意，思考下一步工作的重点应放在何处。
当受差遣的使徒回到耶稣那里，将一切所作的事，所传的道全都告诉他时，他果断地对他们说：“你们来，同我暗暗地到旷野地方去歇一歇。”于是，他们连吃饭也顾不上，便坐船出发往旷野里去了。（太13；约4）
逾越节洁净圣殿
逾越节一天天的靠近了，这是犹大人的重大节日，耶稣准备在圣城耶路撒冷度过这个喜庆的日子。
来到圣城耶路撒冷，耶稣要做的头一件事就是到圣殿去朝拜他的父亲。
好久没有进圣殿了，如今的圣殿是否依然如；日呢？耶稣走进了圣殿，圣殿的景象令耶稣怒火中烧。这是什么样的圣殿呀，简直成了交易市场，只见庭院里商贩云集，有的在兑换钱币，有的在买卖牛羊，还有的将鸽于卖给朝拜的人，呛喝声不绝于耳，讨价还价此起彼伏。这里已没有了上帝的威严，没有了神圣的气氛。
耶稣取过一条绳子猛烈地抽打着牛群、羊群，那些畜牲叫唤着冲出圣殿，耶稣转身又将商贩们的桌子掀翻在地，把他们兑换的钱币扔得到处都是。他对卖鸽于的说：“把这些东西拿去，不要将我父的殿当作买卖的地方。”见耶稣发怒，商贩们自知有过，大都仓皇逃走。耶稣说：“我父亲的殿应作祷告的殿，你们倒使它成为贼窝了”。
祭司长和文士们看见耶稣的所作所为，听见耶稣的斥骂，简直气得要命，他们暗里谋算着想要除灭耶稣，但一时想不出什么好法子来。
耶稣每天都在圣殿里教训众人，百姓都洗耳恭听。在殿里有瞎于，瘸子到耶稣跟前，他就治好了他们。于是就有小孩子在殿里欢呼道：“啊，大卫的子孙，你多么伟大。”祭司长和文士们听见这句话就非常恼怒，他们责问耶稣道：“这些人所说的，你都听见了吗？你怎么配呢？”耶稣回答说：“是的，经上说：'你从婴孩和吃奶的口中完全了赞美的话。'你们没有念过吗？”
祭司长并不死心，他又想出计策刁难耶稣，他得意地望着耶稣说：“你既然显示了这些奇迹，那么你能不能再显示一下，让这座圣殿重新变得清洁呢？”耶稣说：“你们把这座殿拆了吧，三日之内我一定会再建造一座新的。”那祭司长掩饰不住欣喜他说道：“这殿总共了四十六年的时间才建成，你说你三日之内就能重新建成，岂不是说大话？说大话的人可是没有好下场的哟！”当时在场的人谁也没有理会到，耶稣当时说的，就是把他自己的身体比为圣殿，譬喻他在受到杀害后，将于三日内复活。后来当这件事发生时，他的门徒才醒悟过来。
三日之后，犹大人欢庆的逾越节到来了，一座崭新的圣殿耸立在人们的眼前，那么庄严，那么辉煌。人们简直不敢相信自己的眼睛，他们欢呼着，跳跃着，庆贺这个奇迹的出现。
祭司长及文士们在这个奇迹面前本应是无话可说的，可他们仍然不甘心地追问耶稣：“你究竟是谁？你凭什么权柄作这些事？给你这个权柄的又是谁？”
这次耶稣不再回答他们，他反问他们道：“我也要问你们一句话，你们先告诉我，约翰的洗礼是从天上来的，还是从人间来的呢？”
祭司长和文士们面面相觑，他嘀咕着：“我们如果说'从天上来的，'他必然会说'你们为什么不信他呢？，我们如果说'从人间来'，百姓又要用石头砸死我们，因为他们都相信约翰是先知。”
于是他们回答道：“我们不知道从哪里来的。”耶稣便对他们说：“我也不告诉你们，我仗着什么权柄作这些事。”（大21）
与尼哥底母论重生
耶稣洁净圣殿之后，在耶路撒冷继续传播天国的福音，并显示了很多奇迹，令许多在耶路撒冷过逾越节的人都信服了他，就连犹太上层中少数正直的人也信了他，尼哥底母便是其中的一个。
这尼哥底母是犹太人的官。他在逾越节期间多次挤在人群中和百姓一起聆听耶稣的道，他很敬佩耶稣，很想和他交朋友，但他又很怯懦，不敢在大庭广众之下去追随耶稣，他怕他的举动会引起别人的不满。
当夜幕降临时，尼哥底母匆匆来到耶稣的住所，他庆幸没有人在黑暗中能看见他。
见到耶稣，尼哥底母恭恭敬敬他说：“先生，我知道你是从神那里来的，因为你所显示的奇迹是其他人所不能显示的，若没有神同在，无人能行。”
听见尼哥底母这样说，耶稣便回答道：“我实实在在地告诉你：人若不能重生，就不能进到上帝的天国，也不能看到天国里的一切。”
尼哥底母一时也难理解这句话的意思，他困惑地问道：“人已经老了，怎么还能重生呢？难道还要再进到母亲的腹中像婴儿一样地生出来吗？”
耶稣只好对他说道：“我实实在在地告诉你，人是从水和圣灵生的，如果不是从水和圣灵而生，就不能进上帝的天国。从肉身生的，就是肉身，从灵生的，就是灵。我对你说：'你们必须重生'，你一时理解不了，也不必感觉得希奇。打个比方说，风随着意思吹，你可以听见风吹的声音，却不知道它从哪里来，要往何处去。凡是圣灵生的，就是这个样子。”
尼哥底母仍然不解，他继续问道：“怎么会有这种事情呢？”
“尼哥底母。”耶稣顿了顿说道。“你是以色列人的先生，以你的聪明和智慧，难道还理解不了这个最简单的意思吗？我不妨告诉你，我们所说的，是我们知道的；我们所见证的，是我们见过的，你们却不领受我们的见证。我对你们所说的都是地上的事，你们都还不相信，我如果讲起天上的事情，你们又怎么会相信呢？除了从天上降下，依旧在天的人于，再也没有人升过天。你们都知道摩西是怎样在旷野里将大蟒蛇举起来，我告诉你，上帝的儿子也同样被举起来，他要叫一切相信他的人都在他里面得到永生。”
听了耶稣的话，尼哥底母开始有些明白了，他不停地点着头。
耶稣又继续说道：“上帝怜爱世人，他甚至将他唯一的儿子赏赐给他们，他要叫所有相信他的人，都不会被灭亡，反而得到永生。因为上帝差遣他的儿子降临人世，不是要给世人定罪，而是要让世人因为他的到来而得到心灵上的拯救。相信他的人，不会被定罪；不相信他的人，罪已经定了，因为这些人不相信上帝的独生子的名。”
见尼哥底母听得很是入迷，耶稣兴奋地接着说了下去：“光来到世间，世人因自己的行为是恶的，不爱光倒爱黑暗，定他们的罪就是在此。凡作恶的便恨光，并不来就光，恐怕他的行为受责备；但行真理的必来就光，要显明他所行的是靠神而行。”
虽然并没有完全听懂耶稣所说的每一句话，但尼哥底母已从心底里彻底地相信耶稣。从那以后，他便暗地里追随了耶稣，成为耶稣的一位门徒。但他直到耶稣殉难以后，才承认了自己的信仰。尼哥底母是法利赛人中少数追随耶稣的。法利赛人是犹大人中的支派之一，他们多有充当律法师和文士的。由于他们对基督教采取排斥打击的态度，耶稣称他们为“伪善者”。“法利赛人”成了恶名。（太21；约2；约3）
在撒玛利亚井边论道
耶稣在传播福音的同时，行了许多奇迹，越来越多的人相信他是上帝的儿子，就是那弥赛亚，彼得等人跟随他也在这时。
当时，还未下狱的约翰在靠近耶路撒冷的哀嫩施洗，因为那里水多，众人都去受洗。一天，约翰的门徒对约翰说：“先生，从前你曾经在约但河外为他做过见证的耶稣也在为人施洗了，大家都往他那里去，包括以前许多在我们这里受洗的人也去了。”约翰听得他的门徒在不停地抱怨耶稣的施洗，淡淡地一笑，对他们说：“我曾经告诉你们我不是基督，我是奉上帝的差遣来为基督开路的，现在他来了，人们当然应该追随他。你们听说过吗，娶新妇的就是新郎，新郎的朋友听见新郎的声音就会非常高兴，就是这个样子，我听说人们都去追随了耶稣，我就已经感到高兴、感到满足了。耶稣必然兴旺，我必定渐渐衰微。”
尽管约翰告诉了门徒事实的真相，并表露了自己的心迹，但他的门徒们有的依然感到不满。这时，“法利赛人听说耶稣施洗的人比约翰还多，他们也开始注意起他来了。耶稣决定暂时离开犹大地，前往加利利去。
在犹太通往加利利的途中，必须经过撒玛利亚。撒玛利亚有一座城名叫叙加，靠近雅各给他儿子约瑟的那块地，在那里有口古井就叫雅各井。
这天正是正午时分，耶稣走路走得十分困乏，又感腹中饥饿，便打发他的门徒们去弄点吃的来，他自己坐在古井旁边休息。
有一个撒玛利亚的妇女来打水，耶稣对她说：“请你给我水喝。”那妇女很不高兴他说道：“你既然是犹太人，怎么还要问我这个撒玛利亚妇女讨水喝呢？”原来犹大人与撒玛利亚人之间由于历史上的一些原因，始终有着很深的成见，始终没有任何往来。
当下耶稣回答道：“你如果知道上帝的恩赐，你如果知道向你要水喝的人是谁，你肯定早就要求他了，他肯定也早就给了你活水。”
那妇女撇了撇嘴说：“先生，没有打水的器具，井又如此的深，你从哪里弄活水来？告诉你，这井是我们的祖先雅各留下来的，他自己和他的儿子还有牲畜都是喝这口井里的水。难道你比喽还大？”
耶稣回答说：“你们喝了这口井里的水还会再渴，还得一次又一次地来打水，如果喝了我赐给你们的水，就永远不会渴了。我所赐的水，要在人群中间成为源泉，直涌到永生。”
听了耶稣的话，撒玛利亚妇女急忙说：“先生，请你把活水赐给我，让我