拿破仑被战争的胜利捧到了不可一世的地位，自我意志无限扩张，谋求新的胜利、新的荣誉、新的权力、新的空间已成为他生命中不可缺少的一部分。他决定要给英国以致命的打击，1806年11月22日，拿破仑在柏林颁布了著名的“大陆封锁令”，强迫整个大陆屈从自己的意志，同英国在经济上打一场殊死战。
外交大臣塔列兰被召到波茨坦宫谒见皇帝，皇帝命令他立即向一切附庸国或半附庸国发出“大陆封锁令”。这一法令宣布英国各岛处于被封锁状态，禁止欧洲大陆各国同它们有任何通商往来；法国及其盟国军队不论在何处发现英国货物和臣民，将分别予以没收和监禁；任何违反此令的船只，都将作为战利品加以扣留。总之，凡是法国势力所及之处，都不得同英国有任何交往，否则都被认为是犯罪，是对拿破仑尊严的背叛。拿破仑命令元帅们尽可能逐步完全地占领北海和波罗的海沿岸地方，在那里派上法国税吏和宪兵，以杜绝和消灭走私行为。
欧洲以沉默的、恐惧的顺从态度接受了封锁法令。这一法令暂时斩断了英国和欧洲的联系，这对一直用别人的手发动一次又一次反法联盟的英国是一次极为沉重的打击。英国还从来没有同如此强大的对手较量过，它的英镑暂时失去了作用，它唆使别人为自己火中取栗的政策暂时失去了活动场所，英国第一次面临着整个欧洲大陆的挑战。这是一次殊死的搏斗，英国为了摆脱困境，又一次去找它的盟友俄国，告诉亚历山大，如果他再恢复同拿破仑的斗争以拯救普鲁士，英国将给予他财政上的支持。英国也去找了奥国，但奥国仍对奥斯特里茨战役中的惨败心有余悸，而且奥国也极愿意看到普鲁士的毁灭，因为普鲁士在1805年没有参加第三次反法联盟。尽管奥国在犹豫不决，但在彼得堡，英国如愿以偿了。
11月21日，普王在奥斯泰罗德召开御前会议，讨论和约之事。会上意见分歧极大，斯坦因、福克斯和贝米等重臣坚决反对这些丧权辱国的条件，而主和派豪格维茨等则主张忍让。正在争论之时，传来消息说英国已说服俄国帮助普鲁士对付法国，俄国军队已在西进之中。普王精神为之一振，决定拿起武器再战，以雪亡国之耻。
12月1日，普王下诏整顿军队，严惩失职将领。什切青、马格德堡等要塞守将，因不战而降，被撤职查办；作战不力而降、临阵脱逃者也处以严刑；英格尔里本因弃守库斯特林而被处死。普鲁士军民激于覆军亡国之痛，也都愿意武装再战。
法国派往各国的间谍很快将英俄谈判的情况报告给了拿破仑皇帝。拿破仑一面实施大陆封锁的各种措施，一面征召军队，准备将俄国军队消灭在西进途中。
波兰战役
俄国急于报奥斯特里茨失败之仇，15万人的军队开进波兰，气势汹汹地朝法军旗去。拿破仑也不示弱，立即发出向东挺进的命令，他要在即将到来的冬季里给俄军以打击。他认为不能等待春天再行动，届时俄国人将会集中一支巨大的兵力，而且奥国也可能会被诱惑加入他们的阵营。然而，在严寒的冬季，与尚不知其实力与潜力的俄军交战无疑是一次艰巨而冒险的行动。法国大军团共14万人，要前进1000里去打一场艰苦的战役，不仅要供应军粮，而且还要重新装备过冬用具和补给冬衣，同时所经过的地区都是些森林、沼泽等人口稀少的地带。不过，这些并难不住拿破仑，耶拿战役之后，他曾发布一道命令，规定了柏林城以及其鲁士各附庸所应进贡的物品及数量。这时，各普鲁士城市奉命制造28万件大衣和25万双军靴，还要组成6座总医院，包括一个专门治疗性病的医院在内。柏林要制造6000床医院床垫和9000件医院床单。
同时，拿破仑积极展开外交活动。首先，他利用波兰人民的独立情绪建立了一支波兰军队。波兰在1795年第三次被奥地利、普鲁士和俄国瓜分以后，人民一直渴望摆脱被压迫的困境，结束被瓜分的局面。拿破仑为了取得波兰人的支持，保障未来作战中后方交通线的安全，同时也想在与沙俄的冲突中争取建立一个中间缓冲国，敏锐地抓住了有利的时机和条件，积极支持波兰人实现独立的愿望。他号召波兰人拿起武器，与法军并肩战斗，把瓜分者彻底打垮。波兰人积极响应了拿破仑的号召，迅速组织起一支30000人的部队，支持法军的行动。
拿破仑还煽动了俄国边境的土耳其和波斯的反俄情绪，这两个国家在俄国南部边界制造了不少麻烦。他们出兵侵入了多瑙河下游，在高加索占领了沙俄的领土，迫使俄国派出一部分军队越过普鲁特河，去征服土耳其和波斯。这样，当拿破仑在波兰扎扎实实地进行战争准备工作时，沙皇却分散了精力，陷入了拿破仑为他准备的两面作战的圈套。
拿破仑以惊人的旺盛精力和广泛的活动才能完成了这一系列的准备工作之后，立即开始了他的军事行动。1806年11月，法军开进波兰，受到波兰人民的热烈欢迎。11月末，拿破仑得到消息说，俄军的先头部队已经进入华沙，他命令缪拉和达武立即前往迎敌。
拿破仑的大本营设在波兹南，波兰贵族纷纷派代表团来到这里，恳求拿破仑立即重建独立的波兰王国。拿破仑出于多方考虑，虽表示支持波兰人的独立，但没有提出任何重建波兰独立国家的实质性措施。他知道一旦他立即采取行动重建波兰独立国家，奥国会因失去波兰这样一个富庶而重要的省区而重上战场，俄国人也将因失去波兰领土而作殊死的战斗，这与俄国仅仅为履行作为普国的盟国的义务而作战是不同的。那时，法军面临的敌人将是强大的。他对他的后任秘书拉普说：“我喜欢波兰人，他们的热忱性格令我高兴，我愿意使他们成为独立的民族，但那是谈何容易的事，这蛋糕分到手的人太多了，奥地利、俄罗斯、普鲁士各得一块，而且，火头一经点燃，谁知道大火烧到何处为止。我首要责任是对法国的，我不能为了波兰而牺牲法国的利益。总之，我们得把这事交给宇宙的主宰——时间，不知时间告知我们该怎么办。”
缪拉奉命率66000人前去占领华沙和普罗次克之间的维斯瓦河一线。面对法军的推进，俄军前卫指挥本尼格森放弃华沙，向北撤退到纳雷夫河上，以待后续部队开来。12月19日，拿破仑把他的大本营由波兹南迁到华沙。23日，将法军分成左、中、右三路，开始渡过维斯瓦河，向俄军发起全面进攻。
面对来势汹汹的法国三路大军，年老的俄军总司令卡门斯基感到有被切断退路的危险，决定继续向东北方向撤退，但他手下的两员大将本尼格森和霍夫顿拒绝撤退，他们坚持要以纳雷夫河为依托，阻止法军东进。于是，俄军在维希库夫、普乌土斯克和戈维明一线展开，以待法军来攻。
12月26日，法军右翼拉纳军对普乌土斯克的本尼格森阵地发起勇猛攻击，没想到俄军炮火十分猛烈，拉纳几次冲锋均被击退，损失惨重。拿破仑又集中苏尔特、达武、奥热罗三个军向坚守戈维明阵地的霍夫顿发起进攻，霍夫顿军同样进行了顽强的抵抗。经过一天的激战，俄军被迫放弃阵地，向东北方向撤退。这天的天气十分恶劣，时而下雨，时而飘雪，纳雷夫河谷变成了沼泽地，泥泞满路，有些地方竟至人陷过膝，马陷及腹，车陷过轴，俄军放弃了一切火炮，有秩序地撤走了。法军因损失较大以及道路难行，无法继续追击俄军。
战斗过后，双方都在吹嘘自己的胜利。10月29日，拿破仑给皇后约瑟芬写信道：“亲爱的，我只能告诉你一句话，我现在正住在一间破谷仓里，我已击败了俄国人，并夺获了30门炮和他们的辎重，俘获了6000人。但天气极坏，不断地下雨，而且泥深过膝。”俄国的本尼格森在给亚历山大的报告中也吹嘘说，他在普乌土斯克将拿破仑打伤了。不管双方如何吹嘘，他们心里都明白：自己的对手是强大的，是不容易对付的。
面对恶劣的天气及各种必需品奇缺的状况，法国部队已不像往常那样热情高涨，而是口出怨言，意气沮丧。当拿破仑骑马经过部队时，再也听不到“皇帝万岁”的欢呼声，听到的只是长途行军后的痛苦呻吟声。北方的严冬、路面的泥泞以及士气低落使得拿破仑认为继续作战已不可能，他决定让军队就地宿营过冬，以待来年春季采取行动。
俄军退到了纳雷夫河上游的沃姆日阿及其以北地区。由于卡门斯基年老体弱，力不从心，在前次作战中远远落在战场后面，沙皇只好免去了他的职务，命令本尼格森接任俄军总司令。本尼格森见法军停止军事行动，也让俄军宿营过冬。
这时，一个意外事件打破了拿破仑的冬营计划。内伊的第6军宿营在沃斯特鲁达地区，由于此地人烟稀少，难以满足部队就地补给的需要，内伊擅作决定，派出一支部队向北面较为富饶的地区进行一次突袭，以取得更多的给养。内伊的鲁莽行动给本尼格森造成一种错觉，以为法军又开始了作战行动，于是，他立即率领63000人向西前进，企图将内伊赶过维斯瓦河。1月25日，俄军迅速反攻到莫龙格地区。这一突如其来的反击，严重威胁到法军左翼和托伦这个前进补给基地的安全。1月25日，贝尔纳多特的第一军向莫仑格开进，挡住了俄军的进攻。
拿破仑对内伊的鲁莽行动极为恼怒。此时开战，对法军非常不利。可事情既已如此，拿破仑只得迅速作出反应。1月29日，他命贝尔纳多特军实施机动防御，采取诱敌深入的方法，且战且退，把俄军诱到维斯瓦河一线，其余兵力则向敌侧后实施大迂回，切断敌军退路，然后加以合围歼灭。贝尔蒂埃立即派人将皇帝的命令送往各军。法军开始顶着鹅毛大雪飞速行军，拿破仑�