葡萄牙对其所给予的便利限制得很严格。英联邦成员国有权使用特尔赛拉岛上的拉任斯机场，在紧急情况下也可以使用圣米格尔岛上的拉博德佩绍机场，同时船只还可以在法亚尔岛的奥尔塔港加油，进行粮食补给和修理。其他同盟国家则除了护航船只或者执行与护航有关任务的船舶可以得到加油的方便之外，实际上仍然是一无所获。为拉任斯机场运输供应品的非英联邦船只必须由英联邦军舰和飞机护送。“两国政府注意到，葡萄牙政府在同联合王国……协议的条件下奉行一项中立的政策正是出于两国更高利益的需要”，因此两国政府“根据目前的战略形势，同意把在亚速尔群岛的各种便利减到必不可少的最低限度”。但是葡萄牙政府仍然将对提出的在新情况下重新考虑目前协定的最后请求，给予“最友好的考虑”。有关军事安全的补充协定将在以后签订，这些协定包括对轴心国侨民和其他外国人的管制和对通讯特别是对奥尔塔海底电台的管制。协定中没有明文规定何时终止这些便利，但是，10月12日，丘吉尔在下院宣布，这些条款只是暂时性的，它们决不会损害葡萄牙保持其主权；他还宣布一俟战争结束，全部英军就将撤离。
英国政府作为交换条件，向葡萄牙保证，如果该协定导致了对葡萄牙本土的进攻，英国将尽力给予一切军事支援，并且邀请葡萄牙派一代表团立即访问英国，商讨防御计划，对此英国将提供武器和专门技术人员。英国还同意保护葡萄牙商船（这些船只将包括在护航之内）和远洋渔轮，修订战时贸易协定以及供应品购买协定，并且改进运输设施，“以解决国民的供应困难，特别是食品和燃料供应的困难”。10月12日，艾登和萨拉查互换了协定及信件，双方都强调了这些便利的防御性质；同时，丘吉尔宣布，该协定决不影响葡萄牙在欧洲大陆上保持中立的政策（英国政府对此曾宣布表示充分同情），从而维护了伊比利亚半岛的和平区。
同一天葡萄牙政府发表声明，引用了丘吉尔声明的要点，宣布葡萄牙的中立一贯是以英国有权援用英葡联盟为条件的，并且向国民保证，葡萄牙对西班牙的义务因英国政府的完全赞同而得到了保证。葡萄牙政府已向西班牙作了充分的解释，而英国驻马德里大使也将确认这些保证。最后，当前对英国所作的让步，由于其加强了英葡联盟，并为再次肯定现有的这些保证提供了一个机会，它既证明了英葡友谊，又保证了这种友谊在未来将变得更加亲切。11月26日，萨拉查向国民大会演说时满意地详述了英国重新肯定的这些保证，特别是因为英国的一些自治领和联合王国一起作出了这项尊重整个葡萄牙帝国主权的保证。萨拉查对美国的保证也表示赞许。
根据协定，英国向葡萄牙提供价值约一千五百万英镑的军需物资。这笔物资的代价，以葡萄牙在它的领土上为英国军队提供的物品和服务，包括葡萄牙在拉任斯机场开支的各种费用抵付。11月26日，萨拉查声明，虽然对所提供的这些物品和服务的现金价值无法精确计算，但总起来说，无疑葡萄牙是受益者。他说，由于葡萄牙同时也以“很高的代价”从德国、意大利和瑞典获得军需物资，以致现在葡萄牙已重新武装到一度似属渺茫梦想而今却成了防卫上必不可少的最低要求的程度。甚至在协定签订之前已有大批来自英国的军需物资到达了。在协定生效前这段间隔时期内，也许是为了给国内外敌人造成深刻的印象，葡萄牙政府让全世界都晓得，他们正在重新武装起来，因为最近在那里发生了几起抢粮骚动和罢工事件，特别是在墨索里尼垮台之后。随着协定生效之日接近，使人感到不仅在亚速尔群岛，而且在帝汶岛，形势越来越紧张了，并且就在前一天即1943年10月11日，进行了军事和民防演习。
然而一切都平静地过去了。德国人也许甚至陷于措手不及，因为12日那天威廉街发言人还未能发表任何明确的方针，到14日，他才声明，德国将对这种明目张胆违反中立的行为提出抗议，但是鉴于葡萄牙只是在压力下才这样做的，因此或将不致产生政治后果。声明暗示其他中立国还是要警惕被卷入类似的策谋活动中去。德国报界均已接到了指示，宣称英、美方面利用了葡萄牙的一场歉收灾难，威吓它签订该项协定。对于那份“古老的羊皮纸”，1373年条约，也采取了一条道义上的路线，据称在第一次世界大战前，甚至在第二次世界大战前不久，这项条约并未能阻止住英国攫取葡萄牙殖民地的阴谋。10月15日，德国在里斯本提交了一份照会，保留由于形势变迁而可能采取任何措施的权利。同天，柏林一则广播讲到了德国有权决定它对葡萄牙的中立承认到什么程度。日本也提出了抗议。但是事情也就到此为止。
亚速尔协定的及时缔结对盟国具有重大价值，虽然若在1943年夏季大西洋战争转折点到来之前就签订了这项协定，甚至会有更大的价值。1943年8月，在首次魁北克会议上提出了为美国提供便利的问题，对于该协定的现有内容联合参谋部是并不满意的；显然，赫尔是带着一旦协定生效它将几乎自动延长的印象离开魁北克的。但是，事情并非如此。萨拉查并不反对为从特尔赛拉岛出发进行抵御德国潜艇的海军巡逻队延长提供便利，但直到1944年7月，他才许可美国在拉任斯机场驻扎一支海上空军中队，纵然这支中队须得置于英国的指挥之下。美国所提出在圣玛利亚岛建造一个空军基地的建议甚至更难获得葡萄牙的同意。原来打算这个空军基地是为葡萄牙政府建造的，同时使盟军能在战时加以使用，战后美国能在那儿享有最惠国权利，并有权用它来作为边沿哨所的供应站。萨拉查经过相当迟疑之后，同意泛美航空公司选择一个地点；美国人希望在同日本决战时充分利用圣玛利亚岛，作为远东空中交通的桥梁，在他们催促之下，1944年7月22日，萨拉查才允许建筑材料在该处起卸，但仍不准其开工。
这时，葡萄牙几乎没有估计到德国进行报复，但是对美国甚至在支付空军基地部分费用而暂时使用基地的借口下进行渗透可能依然惴惴不安，而且在多山和人口稠密的岛上征用如此多的平地必然多少也是一个问题；此外，在有关航运和各种供应品上，萨拉查甚而还要求美国政府作出比它所愿意给的更大让步，作为葡萄牙提供便利的报酬。最后，1944年10月，赫尔警告萨拉查，如果他不立即批准征用圣玛利亚基地和开始施工的话，美国政府将中断关于帝汶岛的参谋人员会谈，拒绝对有关经济或其他任何问题的谈判，并且甚至将限制已经提供的经济援助。此后，谈判进展较为迅速，1944年11月28日，经过美葡之间互换照会和在同一天达成一项秘密协定，商定空军基地应即开始施工，美国使用该基地将不受限制。在某些情况下，英联邦成员国的飞机也可以使用这个基地。这些便利将在战争结束后六个月之内，或者在同日本签订停战协定后终止。如果这些时间还不够用来从远东撤离人员和物资的话，得允许再延长三个月。在建设基地的费用中，葡萄牙应负担的份额规定不超过二百九十八万五千美元，同时，“所有这一切建筑物一旦可付使用时”，将被看作是葡萄牙政府的财产。给予美国的这些便利是作为葡萄牙间接参与收复帝汶工作看待的。
圣玛利亚基地及时完工了，从而可以用来为远东的盟军服务。战争结束后，驻在亚速尔群岛的英美人员就逐步撤退；1946年5月30日，英葡和美葡互换照会，规定了6月2日为把拉任斯和圣玛利亚基地移交给葡萄牙接管的日期，并允许盟国使用拉任斯机场十八个月，以便转移在德国和日本的占领军中服役的飞机。
第八节 澳门和帝汶岛
当战争扩大到太平洋时，葡萄牙特别感到有理由为它在远东的殖民地担忧。澳门位于中国南海岸，就在香港的西面。它已经成为日本占领区中的一块飞地，现在除了无线电之外，它同西方的一切通讯联系都被切断了。但日军和殖民地之间的关系依然平静无事，其后四年期间所产生的主要困难是经济问题。1945年1月16日、2月25日、4月7日和6月11日，美国飞机轰炸了澳门，炸死了一些中国人。美国政府承认负有责任，战后，规定赔偿一百零四万三千七百十四点三五帕塔卡斯（澳门货币），外加利息。
帝汶就不如澳门那样幸运了。随着空军力量的发展，甚至连这个由葡萄牙占领东北部，荷兰占领另一端的迄今为止并不出名的岛屿也具有了料想不到的战略价值，成了澳洲、东印度群岛和欧洲之间的桥梁。葡属帝汶的主要城市帝力有一个良好的水上飞机泊锚地，从达尔文越过阿拉富拉海至该岛只有四百五十英里（1941年时航程为三小时），位于新加坡东南一千三百英里。根据1940年12月11日的一项协定，澳大利亚快达帝国航空公司从翌年1月开始，获权开辟通往帝力的航线，每两周有一次班机。自1940年7月以来，日本人一直在同葡萄牙进行谈判，1941年10月13日终于签订了一项实际与上述协定相同的协定，建立了一条从西太平洋的帛琉群岛到帝力两周一次班机的航线。1937年以来，日本的南洋发展公司一直在帝汶的各种植物园投资和收购产品，并试图取得石油开采权。但是澳大利亚怀疑日本开辟这条新航线的目的不是商业性的而是有战略意义的。
葡萄牙1941年10月23日的官方声明否认它是在压力下同日本签订这一协定的，同时也否认这项协定是表明了对有关国外航空业务的政策有所改变。然而，这时，英国、澳大利亚和荷兰政府都已意识到保护帝汶的重要性，因为它是战斗机飞行于澳大利亚和爪哇间一个必不可少的着陆