在意大利，安德尔斯于1945年2月13日写信给第八集团军司令麦克里里将军，要求把波兰第二兵团的人撤离战线，因为在雅尔塔会议作出这些决定之后，他觉得他没有权利要求这些人作更多的牺牲。但在2月15日和16日同麦克里里将军和马克·克拉克将军举行的会议上，他被说服把他的人留在前线，因为没有别的部队可以调去替换他们。他飞往那不勒斯与陆军元帅亚历山大会商，后者劝他保持冷静，以待事态的发展。接着，安德尔斯应拉奇基耶维奇总统之请飞往英国，于2月20日到达，第二天受到丘吉尔接见。丘吉尔向他保证，波兰并没有被出卖，雅尔塔的决定还是有其公平合理的根据的。他还说，如有必要，盟国没有波兰部队也可过得去。2月26日，当安德尔斯还在伦敦的时候，他被任命为波兰武装部队代总司令，因为博尔…科莫罗夫斯基将军已是德国人的俘虏。然而，自从米科拉伊奇克辞职以后，波兰流亡政府已经丧失了盟国的同情，而且，虽然他们决定他们的部队继续和盟国并肩作战，直到把德国打败，但是安德尔斯和他的部下却发现自己的处境愈来愈孤立了。
（二）关于波兰问题的雅尔塔协议未能履行
从1945年2月24日到4月2日，莫洛托夫、哈里曼和克拉克…克尔在莫斯科会晤了多次，作为三人委员会来安排同波兰领导人磋商，以便改组华沙临时政府，并且决定邀请哪些波兰人来磋商。不同的解释和观点，在雅尔塔会议上原是用模棱两可的词句掩盖起来的，现在却顿时暴露出来了，三人委员会为克服这些分歧而作的努力毫无结果。当该委员会向华沙政府提出准备同它的代表一起在莫斯科进行协商的其他八位波兰领导人名单时，它回答说，参加协商的人应该是能够代表人民意志的，应该声明同意雅尔塔商定的原则。因为消息非常少，莫洛托夫于2月27日建议英美政府派人到波兰去观察和汇报那里的情况；但是克拉克…克尔坚持这决不能含有正式承认华沙政府的意思，哈里曼则建议他们应该等一下，等到他们与华沙政府谈过之后再说，这时莫洛托夫收回了他的建议，虽然其他两人都曾表示原则上同意。莫洛托夫对于别人向他提出的一张二十人的名单表示反对，他说，他所比较了解的唯一的人就是米科拉伊奇克，而他确信此人是不会得到华沙政府同意的。哈里曼和克拉克…克尔则拒绝了莫洛托夫建议的另一份名单，因为它让临时政府享有四对三的优势。3月5日以后，三国政府参加处理这一问题，英美方面认真接受了莫洛托夫2月27日的建议，莫洛托夫这时却试图把这一建议的责任推给西方国家：他说雅尔塔会议上没有提到这一点，而且这会伤害波兰人的民族自尊心。有关这个问题应该直接同华沙临时政府交换意见。在4月2日该委员会的最后一次会议上，莫洛托夫说，这个问题之所以不能取得进一步进展，主要障碍是英美方面坚持要请米科拉伊奇克来参加协商。
同时，自从3月8日以后；由于丘吉尔一再向罗斯福提出请求，因而罗斯福在3月29日，丘吉尔自己在4月1日分别亲自致电斯大林，对有关波兰问题的雅尔塔协议未能履行提出抗议。4月7日，斯大林给他们两人发出了正式答复，还附了一份给丘吉尔的私人电报，对哈里曼和克拉克…克尔在大使委员会上采取的立场提出了反指责。
罗斯福在3月29日给斯大林的照会中表示，他对雅尔塔会议以来的事态发展，对贯彻雅尔塔会议的决定，特别是关于波兰的各项决定所遇到的困难，深感不安。他说，他对俄国人那种明显的漠不关心感到迷惑不解。问题的核心在于苏联政府对雅尔塔决定的解释，特别是他们把波兰民族团结临时政府和华沙临时政府看作实质上是相同的那种明显的假定。他指出，这种解释不符合雅尔塔会议的决定，甚至也不符合作出这些决定之前的讨论；他强调指出，那种只是拙劣地伪装起来的要想永久保存华沙政府的解决办法，美国政府是决不会接受的。莫斯科委员会有权决定该邀请哪些人去莫斯科参加协商，这一权力决不能受华沙政府的限制，也决不容华沙政府分享。他不会排斥莫洛托夫所建议的邀请对象，他期望美国政府的建议也能得到同样的考虑。作为第一步，他建议委员会先召集少数几个能够提出其他人选的波兰领导人。三国政府的首脑应当运用他们的影响，务使波兰的各个对立集团不再相互妨碍，使那里保持平静。他还提出，应按照莫洛托夫2月27日提出的并于当天马上收回去的那一建议，让委员会中英美方面的人员访问波兰。丘吉尔在4月1日给斯大林的电报也是同样的意思。
斯大林在4月7日给罗斯福的答复中声称，委员会工作的陷入僵局，是因为英美大使把雅尔塔宣言解释为应“取消”华沙临时政府，换上一个完全新的政府。他指责哈里曼关于新政府中可能连一个华沙临时政府的成员都没有的说法。雅尔塔会议上商定的是从波兰国内邀请五名波兰领导人，从伦敦邀请三名，但英美政府现在却要求允许委员会的每个成员邀请数额不限的波兰人。委员会只应邀请那些愿意接受雅尔塔宣言、包括接受寇松线的规定并真诚致力于建立波苏友好关系的波兰人。至于派观察员去波兰的建议（本来是莫洛托夫提出的），斯大林的回答重复了莫洛托夫所使用过的论点，即波兰人将认为这是对他们民族尊严的侮辱。在给丘吉尔的复电中，斯大林说对米科拉伊奇克的反对意见可以收回，如果他公开声明接受雅尔塔宣言并赞成在波苏之间建立友好关系的话。
罗斯福同意丘吉尔的意见，认为他们应联名给斯大林一个答复。然而，就在起草这个答复时，罗斯福在1945年4月12日去世了。准备让他签署的那个复文，后来经过讨论，作了某些修改，由新任总统杜鲁门和丘吉尔同意并签字后，于4月18日以他们两人的名义发给了斯大林。他们在复文中说，希望纠正斯大林对英美政策的错误印象，他们否认斯大林所说的美英政府要求允许委员会每个成员邀请数额不限的波兰人。他们提到罗斯福曾建议过，作为第一步，先邀请少数几个波兰领袖；他们对斯大林说，真正的问题在于华沙临时政府是否有权否决候选人。雅尔塔宣言中肯定没有提到这样的权利。他们觉得，俄国人似乎正在退回到雅尔塔讨论开始时关于波兰问题的立场上去。
同时，旧金山会议在有关波兰代表权的问题上发生了节外生枝的纠纷。3月5日，报界获悉，会议既不向波兰流亡政府也不向华沙临时政府发出邀请。3月12日，波兰流亡政府发出了抗议照会，并于3月14日进一步由切哈诺夫斯基向斯退丁纽斯提出口头抗议。切哈诺夫斯基被告知说，打算等波兰民族团结政府按照雅尔塔宣言成立之后向它发出邀请。3月21日，英国外交部政务次官在下院作了同样的答复。
另一方面，有人千方百计想要把华沙临时政府请到旧金山来代表波兰。3月9日，苏联驻华盛顿大使向国务院递交一份照会，建议如果雅尔塔的决定未及在旧金山会议召开前完全实现，应邀请临时政府的成员。接着，华沙政府于3月22日向四个发起国（美、英、苏、中）送了一份照会，敦促它们“以目前行使着职权的波兰共和国临时政府作为波兰代表”予以邀请；3月31日塔斯社又发表了一个公报，声称苏联政府盼望对方早日答复他们3月9日的照会。同一天，斯退丁纽斯递交了答复。他再次表示他的政府希望波兰民族团结临时政府能按照雅尔塔宣言的规定早日成立，以便能及时向它发出邀请；但他说，鉴于莫斯科委员会正在进行协商，他的政府不准备邀请华沙临时政府。
（三）波兰地下政权领袖的被捕
华沙起义结束时，博尔…科莫罗夫斯基将军在向德国人投降之前，把波兰国家军的领导大权委托给了奥库利茨基上校，奥库利茨基上校偕同少数经过挑选的军官和几位没有暴露身分的波兰地下政权的高级政治领袖，偷越了华沙周围的德军防线，并且在俄国人“解放”波兰后，仍秘密地留在波兰。鉴于苏联对待国家军部队的那种做法，特别是在曾经是“两次大战之间的波兰”的东部地区的做法，那些在俄国人防线后面成立的游击队当中，有些人对占领该地的红军抱敌对态度，那是很自然的；在1944年最后几个月和1945年初，俄国人和华沙临时政府不时抱怨说，流亡政府领导下的部队在红军后方采取敌对行动。正是根据这个理由，在雅尔塔会议之前的若干星期中，波兰地下政权的领袖被指责为奸细和叛徒；也正是在波兰国内的这种气氛下，米科拉伊奇克在雅尔塔会议之前建议在华沙举行一次波兰地下政权领袖会议，作为建立一个代表一切民主人士的政府的第一步。他自己后来说，在他辞职以后，波兰民族团结会议的成员对以阿尔齐谢夫斯基为首的伦敦流亡政府感到不满了，于是他们自己主动采取步骤想同俄国人达成一项解决办法。1945年2月末，他们开始同俄国人会谈；对方告诉他们，苏联当局迫切希望各种地下政治力量公开出来，以便能被“吸收到独立的波兰民主力量的整个潮流中去”。这些会谈是在莫斯科委员会审议的同时进行的。
俄国人逮捕十六名波兰地下政权领袖的情况，是不清楚的。副总理扬科夫斯基在3月初接到一个名叫皮缅诺夫的红军上校的书面邀请，请他去出席地下政权的代表和白俄罗斯第一方面军司令朱可夫元帅的代表伊凡诺夫上将之间的会晤，以讨论尚待解决的一些问题。扬科夫斯基得到美、英两国政府的鼓励和流亡政府的批准，但他们都建议他要小心从事。从3月17日到27日，在华沙郊外举行了以扬科夫斯基和波兰地下政权的其他领导人为一方，以皮缅诺夫上校为另一方的预�