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魏征的劝谏也不是事事都对，太宗这次是笑而不纳。这时褚遂良又来奏道：
“魏大夫所言极是，臣也以为宜择高昌可立者立之，召其首领悉还本土，长为藩翰。”
太宗默然不纳，他心中早有考虑。这次御前会议后不久，太宗即下诏将高昌行政区域划归唐王朝版图，改为西州，更置安西都护府，岁调千兵，谪罪人以戍。自此大唐领地东至大海，西至焉耆，南尽林邑，北抵大漠。凡东西九千五百一十里，南北一万零九百一十八里。
西州府安置妥当，太宗乃召侯君集还朝。侯君集率领大军押着麹智盛及其弟智湛凯旋而归。观德殿献俘完毕，太宗从大局出发，封麹智盛为左武卫将军、金城郡公，麹智湛为右武卫中郎将，天山郡公，许住长安。
侯君集作战有勇有智，为唐初名将之一，但此人常常好夸耀自己，惹得人家嫉妒，灭掉高昌国回长安后，侯君集更是得意非凡。不久，有人在背后说闲话道：“高昌王珪文泰死，侯君集方得克。”更有甚者，京师盛传侯君集未经奏请，随意配没无罪之人，而且私藏宝物无数，将士效法，纷纷抢夺财物，军纪十分败坏。有司将侯君集犯法一事上奏后，太宗诏将侯君集下狱，按查其罪。剿灭敌国、奏凯旋师的功臣没过两天舒心日子就被关进监狱，中书侍郎岑文本看不下去了，仗义执言，洋洋洒洒写了十几页纸的疏奏，为侯君集开脱，文本写道：
“君集等人，或位居辅佐，或职隶爪牙，并蒙陛下拔擢，受将士之任。侯君集等不能正人奉法以报天恩，举措肆意，负罪盈积，实宜绳以典刑，以肃纲纪。高昌王昏庸，人神共弃，朝中议者以为地属荒远，均以置之度外。惟陛下运独见之明，授决胜之略，君集等奉行圣算，遂得指期平殄。若论事实，并是陛下之功。君集有道路之劳，未足称其勋力，而陛下天恩弗宰，乃推动于将帅，露布初至，便降大恩，从征之人，皆获恩泽，及其凯旋，特蒙曲宴，又对万国加以重赏。内外文武咸欣陛下赏不逾时，而不经旬日并付大理。虽乃君集等自投罗网，而在朝廷之人，尚未知所犯何罪，恐海内又疑陛下唯录其过而忘其功。
臣以下才，谬参近职，既有所见，不敢默然。臣闻古之人君，出师命将，克敌则获重赏，不克则受严刑，是以赏其有功也，虽贪残淫从，必蒙青紫之宠；当其有罪也，虽勤躬洁己，不免斧钺之诛。故《周书》曰：记人之功，忘人之过，其宜为君也。昔汉贰师将军李广利，捐五万之师，靡亿万之费，经四年之劳，惟获骏马三十匹，虽斩新宛王之首，而贪不爱卒，罪恶甚多，武帝为万里征伐，不录其过。遂封广利为海西侯，食邑八千户。又校尉陈汤，矫旨兴师。虽斩郅支单于，而汤素贪盗，所收康居财物，事多不法，为司隶所系。汤乃上书曰：与吏士共诛郅支，幸得擒灭。今司隶收系案验，是为郅支报仇也！元帝赦其罪，封汤为关内侯，又赐黄金百斤。
又晋龙骧将军王浚，有平吴之功，而王浑等论浚违诏，不受节度，军人得知吴王孙皓宝物并烧皓宫及船。浚上表曰：“今年平吴，诚乃大庆，于臣之身，更为咎累。‘晋武帝赦而不推，拜辅国大将军，封襄阳侯，赐绢万匹。
隋新义郡公韩擒虎，平陈之日，纵士卒暴乱陈后主宫内，文帝亦不问罪，晋爵拜擒虎上柱国，赐物八千段。
由此观之，将师之臣，廉慎者寡，贪求者众，是以黄石公军势曰：“使智，使勇，使贪，使愚。‘故智者乐立其功，勇者好行其志，贪者邀趋其利，愚者不计其死。是知前圣莫不收人之长，弃人之短，良为此也。
臣又闻，天地之道，以覆载为先，帝王之德，以含弘为美。夫以汉武及历代诸帝，犹能宥广利等，况陛下天纵神武，振宏图以定六合，岂独不能行古人之事哉。伏惟圣怀，当自己有斟酌，臣今所以陈闻，非敢私君集等，庶以黄爝之末光增辉日月。倘陛下降雨露之泽，收雷电之威，录其微劳，忘其大过，使君集重升朝列，复预驱使，虽非清贞之臣，犹是贪愚之将。斯则陛下圣德，虽屈法而德弥显，君集等愆过，虽蒙宥而弥彰。足使立功之士因兹而皆劝，负罪之将，由此改节。“
岑文本的奏书虽然长了些，但论据、论证、论点都比较充分，一唱三叹，头头是道。太宗欣赏了好几遍。是啊，正如文本所言，侯君集虽然不够检点，但自古武将鲜有廉慎的，侯君集驰骋疆场，为国立过汗马功劳，玄武门之变，也曾参加预谋。如今刚刚凯旋回京，就被关进监狱，从道义上确实说不过去。太宗长叹一声，提笔在手，亲自签发一道诏书，敕令大理寺无条件放出侯君集。
侯君集平日好矫饰，平高昌后本来觉得风光无限，不成想却被大理寺关了几天监牢。侯君集心中气闷，除对家人、手下乱发脾气外，有事无事就在家中喝闷酒。这天黄昏天雨，侯君集在书房摆开摊子，正准备大灌几觥酒，管家侯七走进来悄悄回道：“老爷，太子詹事张亮张大人来拜。”张亮曾为秦王府车骑将军，与侯君集有点旧交，天阴下雨，有人来访，正好喝上几杯。侯君集忙起身迎出厅来。
张亮也是武人，黄昏时节来拜访侯君集就是为了找酒喝，两人见面，哈哈一笑，而后一起携手步入书房。
酒菜早已摆好，宾主安坐，说了几句寒喧话，开始碰杯喝酒。几杯酒下肚，张亮叹了一口气说：“以后就不能经常找侯哥喝酒了。”
“怎么啦？”侯君集明知故问。
“今上午吏部下了调令，遣我为洛州都督。”
张亮将出为洛州都督一事，侯君集早有耳闻，京官外遣，肯定有原因，说起来还是坏在一个女人之手。先是张亮的原配夫人去世后，张亮又娶了一个姓李的女子为妻。李氏女娇惯成性，生就嫉妒，素有淫行，张亮对她既宠且惮。李氏女过门没多长时间，看中一个卖笔的小子，与之私通。李氏女还对张亮诈称道：“此子是婚前与君好合而生，应收其为子。”张亮不辨真伪，把卖笔小子收进府中，认作亲儿子。除此之外，李氏女还搞些旁门左道，喜欢预知未来，动不动就对张亮所要做的政事加以干涉。李氏女的毛病不想被太宗闻知，念张亮是秦府旧人，太宗并未降罪，只是张亮在东宫呆不下去了，顺理成章被出为洛州都督。这些秽事，怎么来怎么去的，侯君集全知道，他心中带着气，对朝廷不满，酒桌上，却故意激张亮道：
“当年你为秦王府车骑将军时，曾与王保等千余人，阴结山东豪杰，为主上经营洛州大后方，被人诬告，险些丧命，今主上如愿以偿，登上大位，正该事事照顾你，却为何又把你遣到外地？”张亮无言以对，他知道侯君集蹲了几天监狱心里也不满，于是反问道：“你还说我？你为皇上平一国，功高盖世，回来以后还不是照蹲监狱吗？”
说话间，两人已灌了不少酒，张亮话刚一说完，酒往上涌的侯君集“叭”地一拍桌子，捋起袖子吼道：
“要论带兵打仗，谁怕谁呀？我君集也不亚于皇上的本事！”
“说什么话呀！”张亮斜着眼说。
侯君集一把抓住张亮的袖子，问：“公能反乎？当与君同反！”
张亮慢慢拿掉侯君集的手，笑着说：“暂不敢闻命。”
酒桌上说的是酒话，说完后可一笑置之。不想喝完酒回家后，张亮又一五一十向老婆李氏学了一遍。李氏正不想离开繁华的京都，忙撺掇张亮道：
“速速进宫，秘奏圣上知道，说不定就不让你去洛州了。”
张亮听了老婆的言语，急忙进宫，以非常事变求见皇上。太宗以为他有什么大事，在偏殿接见了他。张亮鹦鹉学舌把侯君集要他一同谋反的事向太宗说了。太宗听完后，不想加罪侯君集，对张亮说：
“卿与君集，俱是功臣。君集独以此语语卿，无人闻见，若以此将君集查办，君集言无此事，两人对证，事未可知！”
张亮还想指天发誓证明此事，太宗挥挥手对他说：
“既然领了调令，就早做准备去洛州上任吧，不要东家走西家串说长道短。”
张亮讨个没趣，只得灰溜溜地回家了，从此不敢乱讲。侯君集说谋反一事也不了了之。
几次对外夷用兵都以胜利告终，使太宗更加重视武备的作用。当了皇帝虽不能再亲临战场杀敌，但太宗仍然喜欢骑马射箭，围猎也就成为他必不可少的娱乐和锻炼方式。这年秋八月，太宗下诏要去京兆附近狩猎，当时正值秋后丰收，农民在地里甚忙，抢收抢种，栎阳县丞刘仁轨上书道：
“今秋大稔，民收获者才一二，使之供承猎事，修路建桥，动辄花费一、二万功，实在是妨碍农事。愿少留銮舆旬日，等农民地里忙完了，则公私俱济。”
刘仁轨虽位卑官小，但太宗对他颇有印象。几年前陈仓折卫都卫鲁宁因犯事被关押起来，他自恃品级高，谩骂时为陈仓尉的刘仁轨，刘仁轨气不过，命人杖杀之。地方上把材料报了上去，太宗大怒，命将刘仁轨开刀问斩。但太宗还有些不大明白，说：“何物县尉，敢杀我折卫！”太宗又派人把刘仁轨拿到长安当面诘问。刘仁轨说：“鲁宁虽为折卫，但也是陈仓的百姓，辱臣如此，臣实忿而杀之。”刘仁轨辞色自若，时魏征也在旁边，对太宗说：“隋之所以灭亡，就是百姓强而凌辱官吏，就像鲁宁欺凌刘仁轨那样。”太宗听了，觉得有道理，下令将刘仁轨免死并提为栎阳县丞。刘仁轨敢做敢为，后来做到宰相的位子，此是后话。单说太宗看了刘仁轨的奏表后，点了点头，克制一下自己，下诏将出猎的推迟一个月。
九月中旬，早已等得不耐烦的太宗下令外出游猎，但仍有臣下上书谏阻。太宗生气地对魏征说：“上封事者皆言朕游猎过频。今天下无事，武备�